ANÁLISIS DE CONGLOMERADOS DE DATOS TEMPORALES DE EXPRESIÓN DE GENES

La estricta regulación de genes, ligada al ciclo celular, es un fenómeno universal indispensable para el correcto funcionamiento de los mecanismos celulares. El análisis de conglomerados de genes, mediante métodos de análisis multivariado, es una herramienta poderosa en la predicción de las funcione...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: ALAN FLORES DIAZ
Tipo de recurso: tesis de maestría
Estado:Versión aceptada para publicación
Fecha de publicación:2019
País:México
Institución:Centro de Investigación en Matemáticas
Repositorio:Repositorio Institucional CIMAT
OAI Identifier:oai:cimat.repositorioinstitucional.mx:1008/1033
Acceso en línea:http://cimat.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1008/1033
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:info:eu-repo/classification/MSC/DATOS TEMPORALES
info:eu-repo/classification/cti/1
info:eu-repo/classification/cti/12
info:eu-repo/classification/cti/1208
info:eu-repo/classification/cti/120899
Descripción
Sumario:La estricta regulación de genes, ligada al ciclo celular, es un fenómeno universal indispensable para el correcto funcionamiento de los mecanismos celulares. El análisis de conglomerados de genes, mediante métodos de análisis multivariado, es una herramienta poderosa en la predicción de las funciones de los genes y en la identificación de los conjuntos regulados por un mismo mecanismo. Dos herramientas en la construcción de conglomerados son: los métodos aglomerativos jerárquicos y las mezclas gaussianas. El primero obtiene su versatilidad de las distintas funciones disimilaridades y funciones enlace, el segundo, si bien de manera explícita, toma en cuenta la dependencia de la expresión de los genes con el tiempo en su matriz de varianzas y covarianzas (los sistemas biológicos pueden ser conceptualizados como sistemas dinámicos). Mediante estos métodos desarrollamos análisis de conglomerados de la expresión temporal de 5926 genes de Saccharomyces cerevisiae, en datos provenientes de microarreglos, estudiando la relación que guardan los elementos de los conglomerados, dentro y entre ellos, con funciones biológicas.