El Coalescentes e Inferencia sobre el Espectro de Frecuencia de Sitio

De acuerdo al modelo genético de innatos sitios, cada mutación es heredada y conservada por todo el linaje de un individuo. En este sentido, observar la secuencia de ADN de una muestra de individuos de la misma especie nos permite hacer inferencia sobre su genealógica. Uno de los modelos matemáticos...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: DHYANA DEL SOL SILVA AGUILERA
Tipo de recurso: tesis de maestría
Estado:Versión enviada para evaluación y publicación
Fecha de publicación:2017
País:México
Institución:Centro de Investigación en Matemáticas
Repositorio:Repositorio Institucional CIMAT
OAI Identifier:oai:cimat.repositorioinstitucional.mx:1008/511
Acceso en línea:http://cimat.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1008/511
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:info:eu-repo/classification/MSC/Inferencia Estadística
info:eu-repo/classification/cti/1
info:eu-repo/classification/cti/12
info:eu-repo/classification/cti/1208
info:eu-repo/classification/cti/120899
Descripción
Sumario:De acuerdo al modelo genético de innatos sitios, cada mutación es heredada y conservada por todo el linaje de un individuo. En este sentido, observar la secuencia de ADN de una muestra de individuos de la misma especie nos permite hacer inferencia sobre su genealógica. Uno de los modelos matemáticos más utilizados en genética de poblaciones se el Modelo Wright-Fisher, cuyas genealogías límites para poblaciones grandes son representadas por un proceso estocástico llamado &#923; Coalescente de Kingman. Sin embargo, este modelo no se ajusta apropiadamente para especies con alta variabilidad en la tasa reproductiva. Los modelos Cannings generalizan al modelo Wright-Fisher. Algunos de estos modelos tienen un comportamiento asintótico asociado a un proceso estocástico que generaliza al Coalescente de Kingman, llamado Coalescente. La ley de cada &#923;-Coalescente está caracterizada por una medida de probabilidad con soporte contenido en [0; 1]: El caso particular en que la medida corresponde a una ley Beta de parámetros 2 -&#945; y &#945;; para 0 < &#945; < 2; es llamado Beta Coalescente. El Beta Coalescente tiene además la peculiaridad de tener al Coalescente de Kingman como objeto límite cuando &#945; &#8594; 2: En esta tesis se construye el modelo asociado al &#923; -Coalescente y en particular al Beta-Coalescente. Existen datos reales de muestras de secuencias de ADN que han mostrado un mejor ajuste con el Beta-Coalescente que con el Coalescente de Kingman. En esta tesis se menciona como hacer inferencia sobre; utilizando un importante estadístico llamado el Espectro de Frecuencia de Sitio, gracias a resultados y herramientas nuevos.