Estudio de genómica comparada de genes bacterianos relacionados con la ruta catabólica inferior del naftaleno: metabolismo del salicilato
El aumento de la presencia de xenobióticos en el medio ambiente ha incrementado el interés por estudiar la degradación de estos compuestos, incluyendo la biorremediación. Dentro de estos xenobióticos se encuentra el grupo de los hidrocarburos aromáticos policíclicos, donde destaca el naftaleno por s...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2021 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/133033 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/133033 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | biorremediación catecol gentisato bioremediació bioremediation catechol Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Sumario: | El aumento de la presencia de xenobióticos en el medio ambiente ha incrementado el interés por estudiar la degradación de estos compuestos, incluyendo la biorremediación. Dentro de estos xenobióticos se encuentra el grupo de los hidrocarburos aromáticos policíclicos, donde destaca el naftaleno por ser el compuesto más simple y, por ende, más estudiado. La degradación del naftaleno por bacterias se lleva a cabo en dos fases, aunque en este caso, el estudio se centrará en la vía inferior que se puede realizar mediante dos vías: la vía del catecol y la vía del ácido gentísico. En este trabajo se propone un estudio de genómica comparativa de genes seleccionados de la vía del catecol (nahG, nahH y nahI), usando a Pseudomonas putida G7 como modelo, y de la vía del gentisato (nagG, nagH, nagI y nagAa) a partir de Ralstonia sp. U2. Como resultado se obtiene un árbol filogenético para cada gen mencionado y, además, la predicción y comparación de algunos operones seleccionados. Se ha observado que en las bases de datos para la ruta del catecol destacan cepas pertenecientes a la clase Gammaproteobacteria, mientras que para la ruta del ácido gentísico destaca la clase Betaproteobacteria. Además, se ha observado una alta identidad de Cupriavidus necator U2 con los genes seleccionados de Ralstonia sp. U2 (a excepción de nagI) y una alta identidad de Pseudomonas sp. MC1 y Pseudomonas umsongensis GO16 con los genes y el operón sal de Pseudomonas putida G7. |
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