Prediction of host-pathogen protein-protein interactions: an integrative model
L’ús descontrolat d’antibiòtics contra bacteris patògens ha accelerant l’aparició de bacteris resistents a múltiples fàrmacs en les darreres dècades i s’està convertint en un greu problema de salut pública a nivell mundial. Per combatre aquesta resistència bacteriana, és fonamental obtenir un bon co...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2021 |
| País: | España |
| Institución: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/674383 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/674383 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Hoste-Patogen Huésped-patógeno Host-pathogen Interaccions proteïna-proteïna Interacciones proteína-proteína Protein-protein interactions Predicció Predicción Prediction Ciències Experimentals 004 |
| Sumario: | L’ús descontrolat d’antibiòtics contra bacteris patògens ha accelerant l’aparició de bacteris resistents a múltiples fàrmacs en les darreres dècades i s’està convertint en un greu problema de salut pública a nivell mundial. Per combatre aquesta resistència bacteriana, és fonamental obtenir un bon coneixement dels mecanismes d’infecció, que es produeixen en gran mesura per la interacció entre proteïnes del patogen i proteïnes de l’hoste. En aquest sentit, cal millorar l’anotació funcional i la caracterització de les proteïnes implicades i de les seves interaccions. Amb aquest objectiu, hem creat les bases de dades BacFITBase i DualSeqDB, que recopilen la informació disponible sobre la importància de gens bacterians i sobre els canvis d’expressió gènica que es produeixen tant en el patogen com en l’hoste durant el procés d’infecció. Així mateix, hem desenvolupat HPIPred, un sistema de predicció d’interaccions proteïna-proteïna entre hoste i patogen. HPIPred està basat en la codificació numèrica de propietats fisicoquímiques dels aminoàcids i és capaç d’integrar informació fenotípica per guiar el procés de predicció. La combinació d’aquestes eines podria servir com a guia en el desenvolupament de nous fàrmacs contra la resistència bacteriana. |
|---|