Framework para el análisis de datos ómicos
Los recientes avances en las tecnologías de secuenciación masiva han simplificado el proceso de obtención de datos ómicos de forma considerable. La disponibilidad y crecimiento masivo de estos datos requiere de herramientas que simplifiquen el proceso de análisis. Con ese objetivo, una nueva herrami...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2019 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/98046 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/98046 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | ómica análisis de datos herramientas web anàlisi de dades eines web òmica data analysis web tools omics Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Sumario: | Los recientes avances en las tecnologías de secuenciación masiva han simplificado el proceso de obtención de datos ómicos de forma considerable. La disponibilidad y crecimiento masivo de estos datos requiere de herramientas que simplifiquen el proceso de análisis. Con ese objetivo, una nueva herramienta es presentada en este trabajo para realizar análisis de expresión diferencial a datos procedentes de experimentos de microarray (Affymetrix) y RNA-Seq. La herramienta cubre el procedimiento habitual de análisis de expresión diferencial: exploración visual de los datos crudos, seguido de la identificación de genes diferencialmente expresados, finalizando con un proceso de anotación y análisis de enriquecimiento. Además, la herramienta permite configurar el análisis y exportar los datos. Para asegurar que puede ser utilizada por la mayoría, la herramienta ha sido diseñada con una interfaz de usuario simple e intuitiva mediante el paquete Shiny de R. La aplicación se encuentra públicamente disponible en Github (https://github.com/RubenSanchezF/TFM.) |
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