Aplicación web desarrollada en Shiny para el análisis de microarrays
Con las ciencias ómicas en auge, los experimentos realizados por los científicos tienen una gran cantidad de datos que procesar cuya curva de aprendizaje, es de gran dificultad y requiere de conocimientos bioinformáticos. La finalidad del TFM, es dotar a dichos científicos de una herramienta que per...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2018 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/82725 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/82725 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | microarrays bioinformática Shiny bioinformàtica bioinformatics Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Sumario: | Con las ciencias ómicas en auge, los experimentos realizados por los científicos tienen una gran cantidad de datos que procesar cuya curva de aprendizaje, es de gran dificultad y requiere de conocimientos bioinformáticos. La finalidad del TFM, es dotar a dichos científicos de una herramienta que permita realizar un análisis de DGE en microarrays de expresión clariom S (Affymetrix) en Homo sapiens, con unos parámetros pre-establecidos y otros controlados por el usuario. Para ello, se define una pipeline en el lenguaje de programación R, para posteriormente implementarla en una aplicación web interactiva mediante el paquete de R, Shiny. |
|---|