Análisis comparativo de los sistemas de regulación transcripcional de la absorción del hierro
El hierro es un elemento esencial para la supervivencia de la mayoría de las bacterias. Este interviene en su crecimiento y tiene un papel fundamental para la patogénesis de estas. De la misma manera que es esencial, en concentraciones elevadas puede ser tóxico, por lo que precisa de mecanismos para...
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2021 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/133100 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/133100 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | comparative genomics motif discovery DNA ADN genómica comparativa genòmica comparativa Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Sumario: | El hierro es un elemento esencial para la supervivencia de la mayoría de las bacterias. Este interviene en su crecimiento y tiene un papel fundamental para la patogénesis de estas. De la misma manera que es esencial, en concentraciones elevadas puede ser tóxico, por lo que precisa de mecanismos para mantener unos niveles constantes. Estos mecanismos conforman la homeostasis del hierro, la cual está regulada en gran parte por la proteína Fur. Esta proteína regula de forma negativa, y algunas veces de forma positiva, la transcripción de varios genes relacionados con la captación de hierro y la patogénesis, por lo que tiene una gran importancia para entender los mecanismos de patogenia y para elaborar posibles tratamientos terapéuticas. En este trabajo se ha estudiado la secuencia de unión al ADN de Fur mediante herramientas de descubrimiento de motivos. A continuación, se ha empleado este motivo encontrado para realizar un análisis de genómica comparativa con CGB. Como resultado de los análisis, se ha obtenido un motivo que sugiere un sitio de unión al ADN de Fur, el cual sigue un modelo propuesto previamente en otro estudio. Tras el análisis de genómica comparativa, se han obtenido elementos regulados por Fur donde se han encontrado diferencias en la regulación para bacterias patógenas y no patógenas, que sugieren un papel de Fur en la patogenia regulando estos genes. Además, se han comparado estos con elementos descritos en la literatura. |
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