Análisis comparativo de genes productores de piRNA en mamíferos
Los piRNAs son secuencias de RNA de 21-35 nucleótidos. Estas secuencias provienen de locus específicos conocidos con piRNA clústers (piCs). Los piRNAs son las encargadas de guiar a las proteínas de la familia PIWI a reprimir la expresión de los transposones (represión transcripcional) o bien de elim...
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2019 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/98546 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/98546 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Piwi-ARNs comparative genomics data mining genómica comparativa minería de datos genòmica comparativa mineria de dades Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Sumario: | Los piRNAs son secuencias de RNA de 21-35 nucleótidos. Estas secuencias provienen de locus específicos conocidos con piRNA clústers (piCs). Los piRNAs son las encargadas de guiar a las proteínas de la familia PIWI a reprimir la expresión de los transposones (represión transcripcional) o bien de eliminar las secuencias nacientes de estos (represión post-transcripcional). Pese a que se ha comprobado la conservación de las proteínas de la familia PIWI, se sabe muy poco sobre la conservación tanto de los piRNAs como de los piCs. En este trabajo hemos estudiado la conservación de los piRNA producidos en genes codificantes y el contenido de regiones repetitivas en una serie de piC predichos en 10 mamíferos distintos. En primer lugar, hemos encontrado que la mayoría de piRNAs génicos se producen en intrones y exones. Seguidamente analizamos la conservación de los genes que producen piRNAs. Hemos obtenido que, a pesar de que la mayoría de los genes se conservan entre los distintos clades observados sólo una pequeña fracción de genes productores de piRNA se encuentran conservados. Finalmente hemos analizado cómo la densidad de repeticiones LTR en los piCs es mayor respecto a los genes y a la región solapada entre piCs y genes ortólogos productores de piRNA. Como conclusión del trabajo obtenemos que existen un número limitado de genes productores de piRNA que conserven esta función entre los diversos mamíferos estudiados. Sin embargo, estos genes conservados mantienen características similares entre ellos sugiriendo un mecanismo de creación distinto al resto de piCs. |
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