Crystal structure of human granzyme B
Estructura Tridimensional de Granzima B humana Granzima B es la proteina prototípica de la familia de serina proteasas que se encuentran en células NK y CTLs. GzmB induce apoptosis mediante activación de las caspasas, y está implicada en la etiología de la artritis reumatoidea. Hemos cristalizado y...
| Autor: | |
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| Formato: | tesis doctoral |
| Fecha de publicación: | 2003 |
| País: | España |
| Recursos: | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Repositorio: | Dipòsit Digital de Documents de la UAB |
| Idioma: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:ddd.uab.cat:38160 |
| Acesso em linha: | https://ddd.uab.cat/record/38160 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palavra-chave: | Serina proteïnasa Proteïnes Procarboxipeptidases |
| Resumo: | Estructura Tridimensional de Granzima B humana Granzima B es la proteina prototípica de la familia de serina proteasas que se encuentran en células NK y CTLs. GzmB induce apoptosis mediante activación de las caspasas, y está implicada en la etiología de la artritis reumatoidea. Hemos cristalizado y resuelto la estructura 3D de la GzmB humana a una resolución de 3.1Å. GzmB muestra un plegamiento similar al de catepsina G y quimasa humanas. GzmB exhibe una especificidad de substrato muy inusual ya que corta tras Asp, debido a la presencia de Arg226 en bolsillo de especificidad S1. El sitio de unión del substrato está diseñado para acomodar y cortar hexapéptidos, i.e. IETD_SG, secuencia presente en el lugar de activación de la caspasa-3 y de Bid, sus substratos fisiológicos. Esta estructura ayudará en el diseño de inhibidores que podrian ser usados en la cura de enfermedades inflamatorias crónicas. Granzyme B y el Receptor Manosa-6-Fosfato Independiente de Cationes GzmB cristalizó como dímero, mediante la interdigitación de las cadenas de azúcares unidas a Asn65 en los dos monómeros. GzmB es captada por las células mediante el Receptor Manosa-6-Fosfato Independiente de Cationes. Sugerimos que la GzmB dimérica sea la forma internalizada por las células diana. Hemos modelado cómo posiblemente GzmB se une a su receptor celular. Estructura Tridimensional de pro-Granzyme K humana Hemos determinado la estructura 3D de la pGzmK a una resolución de 2.2Å. pGzmK se parece más a una serina proteasa activa, a pesar de ser un zimógeno. Esta proteina carece de triada zimogénica y utiliza un nuevo mecanismo de estabilización de la forma inactiva. Estructura Tridimensional de una Procarboxipeptidasa de Helicoverpa armigera. H. armigera es un insecto cuya plaga afecta a un gran número de países. Hemos determinado la estructura 3D de una nueva carboxipeptidasa (PCPAHa) de larvas de H. armigera, la primera resuelta de un insecto hasta la fecha. El zimógeno de PCPAHa muestra una estructura similar a las ya resueltas de mamífero. Su sitio de activación presenta el motivo (Ala)5Lys. Es curioso apreciar similar motivo ((Ala)6Lys) cerca del extremo N-terminal del enzima activo. Ser255 agranda el bolsillo S1'de especificidad y influencia las preferencias de substrato de ésta enzima. Hemos modelado el extremo C-terminal del LCI dentro del sitio activo de PCPAHa. |
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