Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes

La reconstrucción metabólica es el proceso computacional que tiene como objetivo elucidar la red metabólica de un organismo a partir de su genoma anotado y otras fuentes de información. El objetivo final de una reconstrucción es desarrollar un modelo metabólico a escala genómica (GEMM), i.e. una rep...

Full description

Bibliographic Details
Author: Ponce de León Capurro, Miguel
Format: doctoral thesis
Publication Date:2018
Country:España
Institution:Universidad Complutense de Madrid (UCM)
Repository:Docta Complutense
Language:Spanish
OAI Identifier:oai:docta.ucm.es:20.500.14352/16087
Online Access:https://hdl.handle.net/20.500.14352/16087
Access Level:Open access
Keyword:579.8(043.2)
Bacterias
Bacteria
Bioquímica (Química)
id ES_2a2ed8352bb432593d084529f5b9cee4
oai_identifier_str oai:docta.ucm.es:20.500.14352/16087
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontesPonce de León Capurro, Miguel579.8(043.2)BacteriasBacteriaBioquímica (Química)La reconstrucción metabólica es el proceso computacional que tiene como objetivo elucidar la red metabólica de un organismo a partir de su genoma anotado y otras fuentes de información. El objetivo final de una reconstrucción es desarrollar un modelo metabólico a escala genómica (GEMM), i.e. una representación in-silico de la red metabólica. Un GEMM se puede utilizar para generar simular el funcionamiento del sistema a través del marco teórico denominado modelado basado en restricciones (CBM). En este contexto, el objetivo principal de esta Tesis es abordar los problemas metodológicos de la reconstrucción y refinado de GEMM, con énfasis en su aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes. En trabajo se pretenden desarrollar nuevas aproximaciones para detectar y resolver inconsistencias estructurales, empleando como casos de estudio metabolismos de bacterias endosimbiontes. Estos aproximaciones también serán empleadas para analizar la consistencia de bases de datos metabólicas. Finalmente, se abordará el problema de la complementación metabólica en bacterias endosimbiontes...Universidad Complutense de MadridMontero Carnerero, FranciscoPeretó Magraner, JuliUniversidad Complutense de Madrid20182018-08-2320182018-08-23doctoral thesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/20.500.14352/16087reponame:Docta Complutenseinstname:Universidad Complutense de Madrid (UCM)Españolspaopen accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessoai:docta.ucm.es:20.500.14352/160872026-06-02T12:44:21Z
dc.title.none.fl_str_mv Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
title Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
spellingShingle Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
Ponce de León Capurro, Miguel
579.8(043.2)
Bacterias
Bacteria
Bioquímica (Química)
title_short Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
title_full Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
title_fullStr Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
title_full_unstemmed Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
title_sort Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
dc.creator.none.fl_str_mv Ponce de León Capurro, Miguel
author Ponce de León Capurro, Miguel
author_facet Ponce de León Capurro, Miguel
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Montero Carnerero, Francisco
Peretó Magraner, Juli
Universidad Complutense de Madrid
dc.subject.none.fl_str_mv 579.8(043.2)
Bacterias
Bacteria
Bioquímica (Química)
topic 579.8(043.2)
Bacterias
Bacteria
Bioquímica (Química)
description La reconstrucción metabólica es el proceso computacional que tiene como objetivo elucidar la red metabólica de un organismo a partir de su genoma anotado y otras fuentes de información. El objetivo final de una reconstrucción es desarrollar un modelo metabólico a escala genómica (GEMM), i.e. una representación in-silico de la red metabólica. Un GEMM se puede utilizar para generar simular el funcionamiento del sistema a través del marco teórico denominado modelado basado en restricciones (CBM). En este contexto, el objetivo principal de esta Tesis es abordar los problemas metodológicos de la reconstrucción y refinado de GEMM, con énfasis en su aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes. En trabajo se pretenden desarrollar nuevas aproximaciones para detectar y resolver inconsistencias estructurales, empleando como casos de estudio metabolismos de bacterias endosimbiontes. Estos aproximaciones también serán empleadas para analizar la consistencia de bases de datos metabólicas. Finalmente, se abordará el problema de la complementación metabólica en bacterias endosimbiontes...
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018
2018-08-23
2018
2018-08-23
dc.type.none.fl_str_mv doctoral thesis
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
dc.type.openaire.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.14352/16087
url https://hdl.handle.net/20.500.14352/16087
dc.language.none.fl_str_mv Español
spa
language_invalid_str_mv Español
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv open access
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.openaire.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv open access
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Complutense de Madrid
publisher.none.fl_str_mv Universidad Complutense de Madrid
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Docta Complutense
instname:Universidad Complutense de Madrid (UCM)
instname_str Universidad Complutense de Madrid (UCM)
reponame_str Docta Complutense
collection Docta Complutense
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869405053485318144
score 15.300719

Similar Items