Reconstrucción y análisis de modelos metabólicos a escala genómica. Aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes
La reconstrucción metabólica es el proceso computacional que tiene como objetivo elucidar la red metabólica de un organismo a partir de su genoma anotado y otras fuentes de información. El objetivo final de una reconstrucción es desarrollar un modelo metabólico a escala genómica (GEMM), i.e. una rep...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Fecha de publicación: | 2018 |
| País: | España |
| Institución: | Universidad Complutense de Madrid (UCM) |
| Repositorio: | Docta Complutense |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:docta.ucm.es:20.500.14352/16087 |
| Acceso en línea: | https://hdl.handle.net/20.500.14352/16087 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | 579.8(043.2) Bacterias Bacteria Bioquímica (Química) |
| Sumario: | La reconstrucción metabólica es el proceso computacional que tiene como objetivo elucidar la red metabólica de un organismo a partir de su genoma anotado y otras fuentes de información. El objetivo final de una reconstrucción es desarrollar un modelo metabólico a escala genómica (GEMM), i.e. una representación in-silico de la red metabólica. Un GEMM se puede utilizar para generar simular el funcionamiento del sistema a través del marco teórico denominado modelado basado en restricciones (CBM). En este contexto, el objetivo principal de esta Tesis es abordar los problemas metodológicos de la reconstrucción y refinado de GEMM, con énfasis en su aplicación al estudio de bacterias endosimbiontes. En trabajo se pretenden desarrollar nuevas aproximaciones para detectar y resolver inconsistencias estructurales, empleando como casos de estudio metabolismos de bacterias endosimbiontes. Estos aproximaciones también serán empleadas para analizar la consistencia de bases de datos metabólicas. Finalmente, se abordará el problema de la complementación metabólica en bacterias endosimbiontes... |
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