Diseño in silico de proteínas específicas para la inhibición de ebvIL-10
El virus del Epstein-Barr (EBV) es un virus gamma-herpes, presente en más del 90% de la población humana, en la cual persiste de manera latente de por vida. Sin embargo, al reactivarse en su huésped es el causante de diversos trastornos y patologías, principalmente la mononucleosis infecciosa. Por o...
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2015 |
| País: | México |
| Institución: | Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada |
| Repositorio: | Repositorio Institucional CICESE |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:cicese.repositorioinstitucional.mx:1007/652 |
| Acceso en línea: | http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/652 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | info:eu-repo/classification/Autor/Proteínas info:eu-repo/classification/cti/2 info:eu-repo/classification/cti/24 info:eu-repo/classification/cti/2414 |
| Sumario: | El virus del Epstein-Barr (EBV) es un virus gamma-herpes, presente en más del 90% de la población humana, en la cual persiste de manera latente de por vida. Sin embargo, al reactivarse en su huésped es el causante de diversos trastornos y patologías, principalmente la mononucleosis infecciosa. Por otra parte, la infección latente del EBV en pacientes inmunocomprometidos se ha asociado a diferentes tipos de cáncer (e.g. linfoma de Burkitt, la enfermedad de Hodgkin, el linfoma no-Hodgkin, el carcinoma nasofaríngeo y la leucemia de células NK). El episoma del EBV codifica para diversas proteínas cuya función es necesarias para su funcionamiento y supervivencia en el huésped. Tal es el caso de la interleucina 10 viral (ebvIL-10), una citocina homóloga a la interleucina 10 humana (IL-10), responsable típicamente del control y terminación de la respuesta inflamatoria del hospedero. La función principal de ebvIL-10 durante la fase lítica de la infección por EBV es contribuir a la reinfección viral, al mediar la inhibición de la respuesta inmune. A la fecha, aún no existe un tratamiento eficaz en contra del EBV cuando este se encuentra asociado a patologías. En este trabajo se propone utilizar a las miniproteínas cystine-knot MVIIA y EETI-II de origen natural para el diseño racional de biomoléculas específicas que permitan inhibir a la IL-10 del EBV. Nuestra hipótesis es que estas biomoléculas “de diseño” podrán evitar que el virus escape de la detección del sistema inmune del hospedero durante la fase lítica y de re-infección. Para la obtención de las diferentes proteínas específicas se llevó a cabo el diseño y modelado de diferentes mutantes de las proteínas MVIIA y EETI-II utilizando el software MODELLER. Posteriormente se refinaron mediante simulaciones de dinámica molecular con el software NAMD, para proceder a realizar el análisis de acoplamiento proteína-proteína (Docking) mediante el servicio en línea ROSIE. Se obtuvieron tres miniproteínas diferentes de cada uno de los andamios, obteniendo un total de seis mutantes potenciales para su análisis de interacción. Aunque aún falta verificar las propiedades de las biomoléculas diseñadas en ensayos in vitro e in vivo, esta tesis permite sugerir que el diseño in silico de proteínas específicas es una nueva alternativa para la creación de fármacos con potenciales aplicaciones terapéuticas para la inhibición de la ebvIL-10. |
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