Bacterias asociadas a muestras de sedimentos y zooplancton en el Golfo de México

Las masas de agua que alimentan al Golfo de México (GM) entran principalmente a través del canal de Yucatán, formando a nivel superficial (<400 m) la corriente de rizo en su extremo este y la cual abandona al GM a través del estrecho de Florida. A mayor profundidad, se detecta en la parte oeste d...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: PABLO BRAVO BAAS
Tipo de recurso: tesis de maestría
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2018
País:México
Institución:Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada
Repositorio:Repositorio Institucional CICESE
Idioma:español
OAI Identifier:oai:cicese.repositorioinstitucional.mx:1007/2517
Acceso en línea:http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2517
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:info:eu-repo/classification/Autor/Vibrio, bacterias degradadoras de hidrocarburos, Golfo de México, PCR, qPCR, sondas, cólera
info:eu-repo/classification/Autor/Vibrio, hydrocarbon degrading bacteria, Gulf of Mexico, PCR, qPCR, probes, cholera
info:eu-repo/classification/cti/2
info:eu-repo/classification/cti/24
info:eu-repo/classification/cti/2414
info:eu-repo/classification/cti/241404
Descripción
Sumario:Las masas de agua que alimentan al Golfo de México (GM) entran principalmente a través del canal de Yucatán, formando a nivel superficial (<400 m) la corriente de rizo en su extremo este y la cual abandona al GM a través del estrecho de Florida. A mayor profundidad, se detecta en la parte oeste del Golfo otras masas de agua, donde la profunda del Atlántico Norte se detecta a partir de los 1000 m. Debido a la riqueza en hidrocarburos en todo el GM, la extracción de petróleo ha sido constante, incrementando el riesgo de un derrame, como el que ocurrió en la plataforma Deepwater Horizon en 2010. Los estudios bacteriológicos efectuados en el GM se han enfocado en las bacterias que intervienen en la degradación del petróleo, y en zonas estuarinas y costeras en bacterias patógenas para el humano como algunas del género Vibrio. Se sabe que el zooplancton representa un reservorio para estos organismos patógenos cerca de zonas costeras, sin embargo, no se ha comprobado si esta asociación se detecta en mar abierto, y tampoco si el zooplancton funge como reservorio para bacterias degradadoras de hidrocarburos (BDH). Debido a lo anterior, en el presente trabajo se determinó la presencia y abundancia de las BDH (Marinobacter spp., Alcanivorax spp. y Cycloclasticus spp.) y de vibrios (Vibrio spp., V. cholerae, V. cholerae ctxA+, V. parahaemolyticus, V. parahaemolyticus tdh+, V. vulnificus y V. alginolyticus) en muestras de zooplancton y sedimento colectadas en el GM durante las campañas oceanográficas XIXIMI-04 (XIX-04) y 05 (XIX-05). Se extrajo DNA genómico para el análisis de las muestras por PCR punto final y qPCR con SYBRgreen I y sondas Taqman, para determinar la presencia y cuantificar la abundancia de las especies estudiadas. No se encontraron BDH asociadas al zooplancton en ambos cruceros, pero se detectó la presencia de vibrios asociados a zooplancton y sedimentos en XIX-04 y sólo en sedimento en XIX-05. En muestras de zooplancton de XIX-04 se detectó la presencia de V. alginolyticus, V. parahaemolyticus toxigénico (tdh+), V. cholerae y V. cholerae toxigénico (ctxA+). Con base en los resultados obtenidos, se concluyó que el zooplancton no representa un nicho idóneo para BDH, pero sí para vibrios, constituyendo la primera evidencia de que vibrios patógenos para el ser humano, como V. alginolyticus, V. parahaemolyticus y V. cholerae, pueden encontrarse asociados al zooplancton en aguas oceánicas del Golfo de México y no sólo en zonas costeras, lo que ...