Aislamiento e identificación de genes de Opuntia streptacantha inducidos en condiciones de estrés abiótico

"Las temperaturas extremas junto con la sequía y la salinidad, constituyen los factores ambientales que más negativamente afectan el desarrollo de las plantas. El nopal (Opuntia spp.) ha desarrollado adaptaciones particulares que le permiten enfrentar las adversas condiciones climáticas de las...

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Detalles Bibliográficos
Autor: CLAUDIA OLIVIA SILVA ORTEGA
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2008
País:México
Institución:Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica
Repositorio:Repositorio Institucional del IPICYT
OAI Identifier:oai:ipicyt.repositorioinstitucional.mx:1010/1826
Acceso en línea:http://ipicyt.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1010/1826
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:info:eu-repo/classification/Autor/ESTs
info:eu-repo/classification/Autor/Estrés abiótico
info:eu-repo/classification/Autor/Genes inducidos
info:eu-repo/classification/Autor/Líneas insercionales de Arabidopsis thaliana
info:eu-repo/classification/Autor/Opuntia streptacantha
info:eu-repo/classification/Autor/Prolina
info:eu-repo/classification/Autor/SSH
info:eu-repo/classification/cti/2
info:eu-repo/classification/cti/24
info:eu-repo/classification/cti/2415
Descripción
Sumario:"Las temperaturas extremas junto con la sequía y la salinidad, constituyen los factores ambientales que más negativamente afectan el desarrollo de las plantas. El nopal (Opuntia spp.) ha desarrollado adaptaciones particulares que le permiten enfrentar las adversas condiciones climáticas de las zonas áridas y semiáridas y representa uno de los recursos de mayor potencial en el aprovechamiento de estas regiones en diversos países. El objetivo principal de la tesis fue aislar y caracterizar genes de nopal inducidos en condiciones de estrés hídrico y calor. Mediante una hibridación sustractiva (SSH) se obtuvieron 122 uni-genes potencialmente inducidos en cladodios de Opuntia streptacantha en estrés hídrico y a 40° C a los 13 días de tratamiento. El análisis de BLASTX mostró que aproximadamente el 78% de los uni-genes obtenidos presenta homología con genes de otras plantas, de los cuales el 9% han sido identificados en condiciones de estrés y el 18% son de función desconocida. Además los uni-genes obtenidos, para los cuales su función ha sido descrita, participan en diversos procesos metabólicos. Mediante análisis de RTPCR semi-cuantitativa confirmamos que 26 uni-genes son sobre-expresados en nopal en estrés hídrico y a 40° C a los 13 días, condiciones en las que se realizó la hibridación sustractiva. Adicionalmente aislamos una variante de procesamiento alternativo (retención de intrón) del uni-gen 27 que codifica para la subunidad alfa de la fosfofructocinasa dependiente de pirofosfato (Ostpdpk?1), expresado únicamente en condiciones de estrés hídrico y calor. Por otro lado obtuvimos la secuencia completa del cDNA de dos isoformas del factor de iniciación de la traducción (Ostsui1; uni-gen 13) mediante PCR inverso de una genoteca de cDNA completa de nopal, utilizando la información del EST de sui1. Además demostramos que el gen sui1 es diferencialmente expresado en diversas condiciones de estrés abiótico"