Análisis de la virulencia de proteínas multifuncionales mediante bioinformática

Las proteínas moonlighting o multifuncionales son aquellas capaces de realizar más de una función. Un 25% de las proteínas moonlighting descritas están implicadas en la virulencia de patógenos. Sin embargo, actualmente no se ha determinado la existencia de motifs o patrones comunes entre estas prote...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Nájar García, Araceli
Tipo de recurso: tesis de maestría
Fecha de publicación:2019
País:España
Institución:Universitat Oberta de Catalunya (UOC)
Repositorio:O2, repositorio institucional de la UOC
OAI Identifier:oai:openaccess.uoc.edu:10609/98607
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10609/98607
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:virulencia
proteómica
proteínas multifuncionales
virulence
proteomics
multifunctional proteins
virulència
proteòmica
proteïnes multifuncionals
Bioinformatics -- TFM
Bioinformàtica -- TFM
Bioinformática -- TFM
Descripción
Sumario:Las proteínas moonlighting o multifuncionales son aquellas capaces de realizar más de una función. Un 25% de las proteínas moonlighting descritas están implicadas en la virulencia de patógenos. Sin embargo, actualmente no se ha determinado la existencia de motifs o patrones comunes entre estas proteínas que puedan relacionarse con su papel en la virulencia. Por ello, el objetivo principal de este trabajo ha sido analizar bioinformáticamente las proteínas moonlighting implicadas en virulencia. Concretamente, la metodología empleada ha consistido en la búsqueda de motifs comunes, en el análisis de los partners de unión de estas proteínas y en el estudio de las regiones de las mismas implicadas en la interacción con el plasminógeno. Uno de los resultados obtenidos ha sido un listado de 240 proteínas moonlighting implicadas en virulencia, compuesto fundamentalmente por enzimas del metabolismo primario de diversos tipos de microorganismos y con la función moonlighting mayoritaria de unión a proteínas del huésped. También se han obtenido motifs comunes en algunas de estas proteínas de microorganismos patógenos, un programa para la búsqueda de los mismos, un análisis de la localización de estos en cada secuencia proteica y un listado de aminoácidos implicados en la interacción de ciertas proteínas moonlighting con el plasminógeno. Con este trabajo se puede concluir que algunas enolasas y GAPDH multifuncionales presentan motifs comunes, en algunos casos cercanos o involucrados en las zonas de interacción de estas proteínas con el plasminógeno. Además, gran parte de estas proteínas moonlighting suele interaccionar con los mismos residuos del plasminógeno.