Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.

La síndrome de càncer de mama i ovari hereditari és una de les síndromes de càncer hereditari més freqüents. Al voltant del 5-10% dels casos s’associen a variants patogèniques en els gens BRCA1 i BRCA2. La identificació d’aquestes alteracions és important per a realitzar un assessorament genètic que...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Rodríguez Balada, Marta
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2020
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/670307
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/670307
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Síndromes Hereditàries
Genètica
Càncer de mama/ovari
Síndromes hereditarios
Cáncer de mama/ovario
Hereditary Syndromes
Genetics
Breast/Ovarian cancer
Ciències de la salut
575
616
id ES_fcdab8384c39aed558abcd65f589e3aa
oai_identifier_str oai:www.tdx.cat:10803/670307
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.
title Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.
spellingShingle Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.
Rodríguez Balada, Marta
Síndromes Hereditàries
Genètica
Càncer de mama/ovari
Síndromes hereditarios
Cáncer de mama/ovario
Hereditary Syndromes
Genetics
Breast/Ovarian cancer
Ciències de la salut
575
616
title_short Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.
title_full Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.
title_fullStr Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.
title_full_unstemmed Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.
title_sort Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.
dc.creator.none.fl_str_mv Rodríguez Balada, Marta
author Rodríguez Balada, Marta
author_facet Rodríguez Balada, Marta
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Martorell Bonet, Lourdes
Gumà Padró, José
Universitat Rovira i Virgili. Departament de Medicina i Cirurgia
dc.subject.none.fl_str_mv Síndromes Hereditàries
Genètica
Càncer de mama/ovari
Síndromes hereditarios
Cáncer de mama/ovario
Hereditary Syndromes
Genetics
Breast/Ovarian cancer
Ciències de la salut
575
616
topic Síndromes Hereditàries
Genètica
Càncer de mama/ovari
Síndromes hereditarios
Cáncer de mama/ovario
Hereditary Syndromes
Genetics
Breast/Ovarian cancer
Ciències de la salut
575
616
description La síndrome de càncer de mama i ovari hereditari és una de les síndromes de càncer hereditari més freqüents. Al voltant del 5-10% dels casos s’associen a variants patogèniques en els gens BRCA1 i BRCA2. La identificació d’aquestes alteracions és important per a realitzar un assessorament genètic que ajudi a prendre decisions mèdiques basades en l’avaluació del risc individual. En l’estudi genètic d’aquesta síndrome, també s’identifiquen variants de significat incert, que dificulten el procés d’assessorament genètic. Per a poder classificar aquestes variants s’utilitzen principalment anàlisis multifactorials que inclouen l’estudi de la cosegregació de la variant, la freqüència poblacional i l’anàlisi del procés d’empalmament. Tot i això, continuen quedant moltes variants sense categoritzar i per això calen altres eines per a identificar i classificar aquestes variants així com estudiar altres gens que ens puguin explicar la causa hereditària de la malaltia. Per tot això, mitjançant els diferents estudis d’aquesta tesi doctoral basats en diferents tècniques òmiques, s’ha pogut classificar algunes variants mitjançant la combinació de freqüència poblacional, anàlisi in silico i estudi de l’ARN. A més a més, s’ha descartat la hipermetilació del promotor dels gens BRCA1 i BRCA2 com a mecanisme hereditari de silenciament gènic en aquesta síndrome, i s’han identificat altres gens, principalment el gen PALB2, com a gens a incloure en l’estudi d’aquesta síndrome. Finalment s’ha fet un estudi basat en metabolòmica que ha permès identificar una empremta característica amb capacitat predictora del fenotip BRCA-like de càncer de mama.
publishDate 2020
dc.date.none.fl_str_mv 2020
2021
2021
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10803/670307
url http://hdl.handle.net/10803/670307
dc.language.none.fl_str_mv Catalán
language_invalid_str_mv Catalán
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 175 p.
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universitat Rovira i Virgili
publisher.none.fl_str_mv Universitat Rovira i Virgili
dc.source.none.fl_str_mv TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
reponame:TDR. Tesis Doctorales en Red
instname:CBUC, CESCA
instname_str CBUC, CESCA
reponame_str TDR. Tesis Doctorales en Red
collection TDR. Tesis Doctorales en Red
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869425487421374464
spelling Aplicació de tècniques òmiques per a la millora del diagnòstic en la síndrome de càncer de mama i ovari hereditari.Rodríguez Balada, MartaSíndromes HereditàriesGenèticaCàncer de mama/ovariSíndromes hereditariosCáncer de mama/ovarioHereditary SyndromesGeneticsBreast/Ovarian cancerCiències de la salut575616La síndrome de càncer de mama i ovari hereditari és una de les síndromes de càncer hereditari més freqüents. Al voltant del 5-10% dels casos s’associen a variants patogèniques en els gens BRCA1 i BRCA2. La identificació d’aquestes alteracions és important per a realitzar un assessorament genètic que ajudi a prendre decisions mèdiques basades en l’avaluació del risc individual. En l’estudi genètic d’aquesta síndrome, també s’identifiquen variants de significat incert, que dificulten el procés d’assessorament genètic. Per a poder classificar aquestes variants s’utilitzen principalment anàlisis multifactorials que inclouen l’estudi de la cosegregació de la variant, la freqüència poblacional i l’anàlisi del procés d’empalmament. Tot i això, continuen quedant moltes variants sense categoritzar i per això calen altres eines per a identificar i classificar aquestes variants així com estudiar altres gens que ens puguin explicar la causa hereditària de la malaltia. Per tot això, mitjançant els diferents estudis d’aquesta tesi doctoral basats en diferents tècniques òmiques, s’ha pogut classificar algunes variants mitjançant la combinació de freqüència poblacional, anàlisi in silico i estudi de l’ARN. A més a més, s’ha descartat la hipermetilació del promotor dels gens BRCA1 i BRCA2 com a mecanisme hereditari de silenciament gènic en aquesta síndrome, i s’han identificat altres gens, principalment el gen PALB2, com a gens a incloure en l’estudi d’aquesta síndrome. Finalment s’ha fet un estudi basat en metabolòmica que ha permès identificar una empremta característica amb capacitat predictora del fenotip BRCA-like de càncer de mama.El síndrome de cáncer de mama y ovario hereditario es uno de los síndromes de cáncer hereditario más frecuentes. Alrededor del 5-10% de los casos son portadores de variantes patogénicas en los genes BRCA1 y BRCA2. La identificación de éstas es importante para realizar un asesoramiento genético que ayude en la toma de decisiones médicas basadas en la evaluación del riesgo individual. En su estudio genético, también se identifican variantes de significado incierto, que dificultan el proceso de asesoramiento genético. Para clasificarlas se usan principalmente análisis multifactoriales que incluyen el estudio de la cosegregación de la variante, frecuencia poblacional y análisis del proceso de splicing. No obstante, siguen quedando muchas variantes sin categorizar, por lo que se necesitan otras herramientas para identificar y clasificarlas y para estudiar otros genes que puedan explicar la causa hereditaria de la enfermedad. Mediante los diferentes estudios que conforman esta tesis doctoral, basados en diferentes técnicas ómicas, se han podido clasificar algunas variantes mediante la combinación de frecuencias poblacionales, análisis in silico y estudio del ARN. Además, se ha descartado la hipermetilación del promotor de los BRCA1 y BRCA2 como un mecanismo hereditario de silenciamiento génico en este síndrome, y se han identificado otros genes a incluir en el análisis de el síndrome. Finalmente, se ha llevado a cabo un estudio basado en metabolómica que ha permitido identificar una huella con capacidad predictiva del fenotipo BRCA-like de cáncer de mama.Hereditary breast and ovarian cancer syndrome is one of the most common hereditary cancer syndromes. At least 5-10% of cases are associated with pathogenic variants in the BRCA1 and BRCA2 genes. The identification of these alterations is important to carry out genetic counselling that helps to make medical decisions based on the assessment of the individual risk. In the mutational study, variants of uncertain significance are also identified, which make the process of genetic counselling difficult. To classify them, strategies based on multifactorial analysis are used, which include as cosegregation analysis of the variant, population frequency, as well as the mRNA splicing. However, there are still many variants that cannot be categorized. That’s the reason why other methods are needed to identify and classify them, as well as to study other genes that can explain the hereditary cause of cancer. Therefore, the studies included in this doctoral thesis, based on different omics techniques, allow us to classify some unclassified variants by means of a combination of population frequency, in silico analysis and mRNA study. Moreover, the hypermethylation of the promoter of the BRCA1 and BRCA2 genes has been ruled out as a hereditary mechanism of genetic silencing in this syndrome, and other genes have been identified as genes to be included in the study of this syndrome. Finally, a metabolomics-based study has been carried out to identify a characteristic fingerprint with the ability to predict the BRCA-like phenotype of breast cancer.Universitat Rovira i VirgiliMartorell Bonet, LourdesGumà Padró, JoséUniversitat Rovira i Virgili. Departament de Medicina i Cirurgia202120212020info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion175 p.application/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/670307TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)reponame:TDR. Tesis Doctorales en Redinstname:CBUC, CESCACatalánADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.info:eu-repo/semantics/openAccessoai:www.tdx.cat:10803/6703072026-06-14T12:46:07Z
score 15,301603