Development of a bioinformatics platform for analysing big data from Omics analyses-Omnalysis

En l'àmbit de la investigació biológica les dues darreres decades han estat considerades com les de l'era de la genòmica. Les dades que es generen mitjançant les tècniques omicas son complexes d'analitzar per investigadors sense uns mínims coneixements de programació. Per pal·liar aqu...

Full description

Bibliographic Details
Author: Tyagi, Punit
Format: doctoral thesis
Publication Date:2022
Country:España
Institution:Universitat Autònoma de Barcelona
Repository:Dipòsit Digital de Documents de la UAB
Language:English
OAI Identifier:oai:ddd.uab.cat:265898
Online Access:https://ddd.uab.cat/record/265898
Access Level:Open access
Keyword:OMICS
Analyses-Omnalysis
Bioinformatics
Ciències Experimentals
Description
Summary:En l'àmbit de la investigació biológica les dues darreres decades han estat considerades com les de l'era de la genòmica. Les dades que es generen mitjançant les tècniques omicas son complexes d'analitzar per investigadors sense uns mínims coneixements de programació. Per pal·liar aquestes dificultats en aquesta Tesi s'ha desenvolupat Omanalysis, una aplicació bioinformàtica a la web per l'anàlisi de dades de transcriptòmica i proteómica. Les seves característiques permeten realitzar en temps real conversions ID, anàlisi de components principals per obtenir correlacions i nivells de variabilitat entre tractaments, gràfics volcano i plot per representar genes i proteïnes diferencialment expresats entre mostres, diagrames de Venn e histogrames per obtenir ontologies de gens i patrons d'enrequiment en estudis funcionals de dades d'expressió gènica i proteòmica.