Development of a bioinformatics platform for analysing big data from Omics analyses-Omnalysis

En l'àmbit de la investigació biológica les dues darreres decades han estat considerades com les de l'era de la genòmica. Les dades que es generen mitjançant les tècniques omicas son complexes d’analitzar per investigadors sense uns mínims coneixements de programació. Per pal·liar aquestes...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Tyagi, Punit
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2022
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/675336
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/675336
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:OMICS
Analyses-Omnalysis
Bioinformatics
Ciències Experimentals
579
Descripción
Sumario:En l'àmbit de la investigació biológica les dues darreres decades han estat considerades com les de l'era de la genòmica. Les dades que es generen mitjançant les tècniques omicas son complexes d’analitzar per investigadors sense uns mínims coneixements de programació. Per pal·liar aquestes dificultats en aquesta Tesi s’ha desenvolupat Omanalysis, una aplicació bioinformàtica a la web per l’anàlisi de dades de transcriptòmica i proteómica. Les seves característiques permeten realitzar en temps real conversions ID, anàlisi de components principals per obtenir correlacions i nivells de variabilitat entre tractaments, gràfics volcano i plot per representar genes i proteïnes diferencialment expresats entre mostres, diagrames de Venn e histogrames per obtenir ontologies de gens i patrons d’enrequiment en estudis funcionals de dades d’expressió gènica i proteòmica.