Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation

Alternative pre-mRNA splicing of the Notch regulator NUMB exon 9 switches between isoforms that promote (exon inclusion) or prevent (exon skipping) cell proliferation. We have studied NUMB alternative splicing regulation by RBM10, an RNA binding protein frequently utated in lung adenocarcinomas. The...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Hernández Ribera, Jordi
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2016
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/458766
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/458766
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:RBM10
NUMB
Lung Cancer
Càncer de pulmó
Alternative splicing
Empalmament alternatiu
577
id ES_f2602b3d71a87e73e972e4acddf97a00
oai_identifier_str oai:www.tdx.cat:10803/458766
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferationHernández Ribera, JordiRBM10NUMBLung CancerCàncer de pulmóAlternative splicingEmpalmament alternatiu577Alternative pre-mRNA splicing of the Notch regulator NUMB exon 9 switches between isoforms that promote (exon inclusion) or prevent (exon skipping) cell proliferation. We have studied NUMB alternative splicing regulation by RBM10, an RNA binding protein frequently utated in lung adenocarcinomas. The study of cancer-associated BM10 variants revealed domains and residues important for RBM10 function. Structure-function analysis identified residues in RRM2 that, without compromising RNA binding, fail to regulate NUMB exon 9. Immunoprecipitation and mass spectrometry analyses revealed interactors that include U2 snRNP and PRP19 spliceosomal components, allowing us to propose a mechanism for 3' splice site repression by RBM10.L’empalmament alternatiu del pre-mARN de NUMB, un regulador de Notch, varia entre dos isoformes que promouen (inclusió de l’exó 9) o prevenen (salt de l’exó 9) la proliferació cel•lular. Hem estudiat la regulació de l’empalmament alternatiu de NUMB controlada per RBM10, una proteïna d’unió al ARN freqüentment mutada en càncer de pulmó. L’estudi de variants d’RBM10 associades a càncer revela dominis i residus importants per a la funció de RBM10. Mitjançant anàlisis estructurals i funcionals hem identificat residus al RRM2 que, quan mutats, no comprometen la unió al ARN però són incapaços d’alterar la regulació de l’exó 9 de NUMB. Anàlisis de co-immunoprecipitació i espectrometria de masses assenyalen interactors que inclouen U2 snRNP i PRP19 que ens permeten proposar un mecanisme de repressió del lloc d’empalmament al 3’ reprimit per RBM10.Programa de doctorat en BiomedicinaUniversitat Pompeu FabraValcárcel, J. (Juan)Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut201820202016info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion196 p.application/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/458766TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)reponame:TDR. Tesis Doctorales en Redinstname:CBUC, CESCAInglésADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.info:eu-repo/semantics/openAccessoai:www.tdx.cat:10803/4587662026-06-14T12:46:07Z
dc.title.none.fl_str_mv Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation
title Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation
spellingShingle Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation
Hernández Ribera, Jordi
RBM10
NUMB
Lung Cancer
Càncer de pulmó
Alternative splicing
Empalmament alternatiu
577
title_short Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation
title_full Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation
title_fullStr Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation
title_full_unstemmed Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation
title_sort Regulation of NUMB alternative splicing by RBM10 and control of cancer cell proliferation
dc.creator.none.fl_str_mv Hernández Ribera, Jordi
author Hernández Ribera, Jordi
author_facet Hernández Ribera, Jordi
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Valcárcel, J. (Juan)
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.subject.none.fl_str_mv RBM10
NUMB
Lung Cancer
Càncer de pulmó
Alternative splicing
Empalmament alternatiu
577
topic RBM10
NUMB
Lung Cancer
Càncer de pulmó
Alternative splicing
Empalmament alternatiu
577
description Alternative pre-mRNA splicing of the Notch regulator NUMB exon 9 switches between isoforms that promote (exon inclusion) or prevent (exon skipping) cell proliferation. We have studied NUMB alternative splicing regulation by RBM10, an RNA binding protein frequently utated in lung adenocarcinomas. The study of cancer-associated BM10 variants revealed domains and residues important for RBM10 function. Structure-function analysis identified residues in RRM2 that, without compromising RNA binding, fail to regulate NUMB exon 9. Immunoprecipitation and mass spectrometry analyses revealed interactors that include U2 snRNP and PRP19 spliceosomal components, allowing us to propose a mechanism for 3' splice site repression by RBM10.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016
2018
2020
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10803/458766
url http://hdl.handle.net/10803/458766
dc.language.none.fl_str_mv Inglés
language_invalid_str_mv Inglés
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 196 p.
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universitat Pompeu Fabra
publisher.none.fl_str_mv Universitat Pompeu Fabra
dc.source.none.fl_str_mv TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
reponame:TDR. Tesis Doctorales en Red
instname:CBUC, CESCA
instname_str CBUC, CESCA
reponame_str TDR. Tesis Doctorales en Red
collection TDR. Tesis Doctorales en Red
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869424274163367936
score 15,300719

Similares en LA Referencia