Estudi d'associació de genoma complet senzill i longitudinal per a caràcters lleters mesurats en cabres de la raça Murciano-Granadina amb tres lactacions registrades
Hem utilitzat dues aproximacions GWAS diferents per estudiar l’associació entre 50.000 polimorfismes nucleotídics (SNP) i caràcters lleters mesurats en tres lactacions registrades en cabres Murcianes-Granadines. En l'Anàlisi 1, s'han realitzat GWAS independents per a cada caràcter i lactac...
| Autores: | , |
|---|---|
| Tipo de recurso: | conjunto de datos |
| Fecha de publicación: | 2024 |
| País: | España |
| Institución: | Consorci de Serveis Universitaris de Catalunya (CSUC) |
| Repositorio: | CORA.Repositori de Dades de Recerca |
| OAI Identifier: | oai:dnet:cora.rdr____::e0d756082d1580e0938bcd6cbe40aa97 |
| Acceso en línea: | https://doi.org/10.34810/DATA1153 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Medicine, Health and Life Sciences Anàlisi d'associació del genoma complet (GWAS) Genome-wide association studies (GWAS) Caràcters lleters Milk traits Dairy traits Estudi longitudinal Estudios de asociación del genoma completo Estudis d'associació del genoma complet Longitudinal studies |
| Sumario: | Hem utilitzat dues aproximacions GWAS diferents per estudiar l’associació entre 50.000 polimorfismes nucleotídics (SNP) i caràcters lleters mesurats en tres lactacions registrades en cabres Murcianes-Granadines. En l'Anàlisi 1, s'han realitzat GWAS independents per a cada caràcter i lactació, mentre que en l'Anàlisi 2 s'ha realitzat un únic GWAS longitudinal, considerant conjuntament totes les dades. Les dades disponibles són els genotipus per 50.000 SNP en 917 cabres Murciano-Granadines i els caràcters (mesurats en 3 lactacions) per la producció lletera (en kg) estandarditzada a 210 dies (MY210), 240 dies (MY240) i 305 dies (MY305), així com els percentatges de greix, proteïna, lactosa i matèria seca de la llet, així com el logaritme natural del recompte de cèl·lules somàtiques dividit per 1000 (SCS, somatic cell score). We used two different GWAS approaches to study the association between 50,000 nucleotide polymorphisms (SNPs) and dairy characters measured in three lactations recorded in Murcian-Granadine goats. In Analysis 1, independent GWAS were performed for each trait and lactation, while in Analysis 2 a single longitudinal GWAS was performed, considering all data together. The available data are the genotypes for 50,000 SNPs in 917 Murciano-Granadine goats and the characters (measured in 3 lactations) for milk production (in kg) standardized at 210 days (MY210), 240 days (MY240) and 305 days (MY305 ), as well as the percentages of fat, protein, lactose and milk dry matter, as well as the natural logarithm of the somatic cell count divided by 1000 (SCS, somatic cell score). |
|---|