Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar

El tomate De colgar o De penjar es un tipo varietal o conjunto de variedades muy populares en todo el arco mediterráno español. Se trata de un tomate que ha sido seleccionado por los agricultores y que es apreciado por su jugosidad, sabor y especialmente por su facilidad de ser restregado en el pan....

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores: García, A., Carbonell, Pedro, Cabrera Miras, José Ángel, Grau Sánchez, Adrián, Alonso Sanchis, Aránzazu, Ruiz Martínez, Juan José, García Martínez, Santiago
Tipo de recurso: artículo
Fecha de publicación:2023
País:España
Institución:Universidad Miguel Hernández de Elche
Repositorio:REDIUMH. Depósito Digital de la UMH
OAI Identifier:oai:dspace.umh.es:11000/36432
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/11000/36432
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:HRM
De penjar
Tradicional
Melting
Genotipado
CDU::5 - Ciencias puras y naturales::57 - Biología
id ES_e4e2ac32ca22f56048d710337bc9d444
oai_identifier_str oai:dspace.umh.es:11000/36432
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgarGarcía, A.Carbonell, PedroCabrera Miras, José ÁngelGrau Sánchez, AdriánAlonso Sanchis, AránzazuRuiz Martínez, Juan JoséGarcía Martínez, SantiagoHRMDe penjarTradicionalMeltingGenotipadoCDU::5 - Ciencias puras y naturales::57 - BiologíaEl tomate De colgar o De penjar es un tipo varietal o conjunto de variedades muy populares en todo el arco mediterráno español. Se trata de un tomate que ha sido seleccionado por los agricultores y que es apreciado por su jugosidad, sabor y especialmente por su facilidad de ser restregado en el pan. Su nombre deriva de las técnicas tradicionales de los agricultores, que cuelgan en la pared racimos de tomates cosidos por sus cálices o pedúnculos, y donde pueden llegar a permanecer largo tiempo sin perder su calidad y textura. Esto se debe a la presencia de un gen de larga vida en su ADN, conocido como alelo alcobaça (alc), el cual se asocia a la ralentización de la maduración postcosecha. En el presente trabajo, se ha diseñado un marcador molecular que permitirá controlar el alelo alc en laboratorio en un proceso rápido, preciso y de bajo coste. Para ello, se ha transformado un marcador CAPS, basado en un SNP entre los alelos alc y ALC, en un marcador para la técnica HRM. Se han realizado diversas pruebas para optimizar la PCR y el melting, con el objetivo de diferenciar inequívocamente los individuos homocigotos y heterocigotos. Este marcador será de gran utilidad para el genotipado de una gran colección de tomate De colgar, permitiendo identificar las accesiones con el alelo alc sin necesidad de realizar largos estudios postcosechaThe De colgar or De penjar tomato is a varietal type or group of varieties very popular in the Spanish Mediterranean coast. It is a tomato selected by farmers and apreciated for its juiciness, flavour and especially for its case of being rubbed into bread. Its name derives from the traditional techniques developed by the farmers, since they hang in the wall bunches of tomatoes sewn by their stalks, where they can stay for a long time without depreciation in quality or texture. This is explained by the presence of a long-life gene in its DNA known as alcobaça (alc) allele, which performances slowing down postharvest ripening. In currently work, we have designed a molecular marker that will allow to control the alc allele in the laboratory in a fast, accurate and low-cost procedure. For this, we converted a CAP marker, based on a SNP between alc and ALC alleles, into a marker for HRM method. We performed several experiments to optimise the PCR and melting, with the aim to unequivocally distinguish the homozygous and heterozygous samples. This marker will be very useful to genotyping a great De colgar tomato collection, allowing identify the accessions carrying the alc allele without the need to perform long postharvest studiesUniversidad Miguel HernándezDepartamentos de la UMH::Biología Aplicada202520252023info:eu-repo/semantics/articleapplication/pdf10application/pdfhttps://hdl.handle.net/11000/36432reponame:REDIUMH. Depósito Digital de la UMHinstname:Universidad Miguel Hernández de ElcheEspañolProyecto PID2022-137735OR-C32: Desarrollo participativo de variedades tradicionales de tomate resistentes a virus con alto valor añadido y adaptadas a la producción con bajos insumos en el Suerte de Españainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/oai:dspace.umh.es:11000/364322026-05-27T13:36:21Z
dc.title.none.fl_str_mv Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar
title Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar
spellingShingle Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar
García, A.
HRM
De penjar
Tradicional
Melting
Genotipado
CDU::5 - Ciencias puras y naturales::57 - Biología
title_short Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar
title_full Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar
title_fullStr Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar
title_full_unstemmed Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar
title_sort Puesta a punto de un marcador molecular para identificar la presencia del alelo alcobaça en el tomate De colgar
dc.creator.none.fl_str_mv García, A.
Carbonell, Pedro
Cabrera Miras, José Ángel
Grau Sánchez, Adrián
Alonso Sanchis, Aránzazu
Ruiz Martínez, Juan José
García Martínez, Santiago
author García, A.
author_facet García, A.
Carbonell, Pedro
Cabrera Miras, José Ángel
Grau Sánchez, Adrián
Alonso Sanchis, Aránzazu
Ruiz Martínez, Juan José
García Martínez, Santiago
author_role author
author2 Carbonell, Pedro
Cabrera Miras, José Ángel
Grau Sánchez, Adrián
Alonso Sanchis, Aránzazu
Ruiz Martínez, Juan José
García Martínez, Santiago
author2_role author
author
author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Departamentos de la UMH::Biología Aplicada
dc.subject.none.fl_str_mv HRM
De penjar
Tradicional
Melting
Genotipado
CDU::5 - Ciencias puras y naturales::57 - Biología
topic HRM
De penjar
Tradicional
Melting
Genotipado
CDU::5 - Ciencias puras y naturales::57 - Biología
description El tomate De colgar o De penjar es un tipo varietal o conjunto de variedades muy populares en todo el arco mediterráno español. Se trata de un tomate que ha sido seleccionado por los agricultores y que es apreciado por su jugosidad, sabor y especialmente por su facilidad de ser restregado en el pan. Su nombre deriva de las técnicas tradicionales de los agricultores, que cuelgan en la pared racimos de tomates cosidos por sus cálices o pedúnculos, y donde pueden llegar a permanecer largo tiempo sin perder su calidad y textura. Esto se debe a la presencia de un gen de larga vida en su ADN, conocido como alelo alcobaça (alc), el cual se asocia a la ralentización de la maduración postcosecha. En el presente trabajo, se ha diseñado un marcador molecular que permitirá controlar el alelo alc en laboratorio en un proceso rápido, preciso y de bajo coste. Para ello, se ha transformado un marcador CAPS, basado en un SNP entre los alelos alc y ALC, en un marcador para la técnica HRM. Se han realizado diversas pruebas para optimizar la PCR y el melting, con el objetivo de diferenciar inequívocamente los individuos homocigotos y heterocigotos. Este marcador será de gran utilidad para el genotipado de una gran colección de tomate De colgar, permitiendo identificar las accesiones con el alelo alc sin necesidad de realizar largos estudios postcosecha
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023
2025
2025
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/11000/36432
url https://hdl.handle.net/11000/36432
dc.language.none.fl_str_mv Español
language_invalid_str_mv Español
dc.relation.none.fl_str_mv Proyecto PID2022-137735OR-C32: Desarrollo participativo de variedades tradicionales de tomate resistentes a virus con alto valor añadido y adaptadas a la producción con bajos insumos en el Suerte de España
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
10
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Miguel Hernández
publisher.none.fl_str_mv Universidad Miguel Hernández
dc.source.none.fl_str_mv reponame:REDIUMH. Depósito Digital de la UMH
instname:Universidad Miguel Hernández de Elche
instname_str Universidad Miguel Hernández de Elche
reponame_str REDIUMH. Depósito Digital de la UMH
collection REDIUMH. Depósito Digital de la UMH
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869422630818283520
score 15,811543