Epidemiological surveillance of swine influenza viruses in pig farms
En el primer estudi de la present tesi, es van estudiar brots de malaltia respiratòria compatible amb virus de la influença de tipus A (IAV) així com granges que no mostraven simptomatologia clínica. Per a l'estudi dels brots, es van recollir mostres de hisops nasals d'animals amb signes r...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2020 |
| País: | España |
| Institución: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/670891 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/670891 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Influença Influenza Virologia Virología Virology Veterinària Veterinaria Veterinary Ciències de la Salut 619 |
| Sumario: | En el primer estudi de la present tesi, es van estudiar brots de malaltia respiratòria compatible amb virus de la influença de tipus A (IAV) així com granges que no mostraven simptomatologia clínica. Per a l'estudi dels brots, es van recollir mostres de hisops nasals d'animals amb signes respiratoris i febre (≥40 ° C), mentre que a les granges sense simptomatologia clínica, es van recollir hisops nasals de garrins de maternitat, transició i porcs d'engreix (20 per grup). Es va estudiar un total de 211 brots i 19 granges aparentment subclíniques. La presència i llinatge es van determinar per RT-qPCR, i es va fer l'aïllament de mostres seleccionades usant cèl·lules MDCK. Els aïllats van ser seqüenciats (genoma complet) mitjançant la tecnologia Illumina Miseq. Es va confirmar la presència de IAV en 145 casos de brots (68.7%), i en 15 granges aparentment subclíniques (78.9%). Els llinatges majorment detectats van ser H1avN2hu (33.6%), H1avN1av (24.3%) i H1huN2hu (18.7%). Es va obtenir un total de 60 aïllats, i els seus genomes van ser completament seqüenciats. Els genotips majoritàriament detectats van ser el tipus D i l'A, que es corresponen als llinatges H1avN2hu i H1avN1av, respectivament. Es van detectar un total de 14 genotips diferents, dels quals, 7 d'ells no havien estat prèviament reportados.En el segon estudi de la present tesi, es va estudiar la dinàmica de transmissió de IAV en les transicions d'una granja endèmica abans i després de l'aplicació de diferents esquemes de vacunació a les truges. Es van realitzar un total de tres estudis longitudinals: abans de la vacunació, després de la vacunació amb una vacuna comercial polivalent inactivada H1N1-H1N2-H3N2 i després de la vacunació amb una vacuna comercial monovalent pandèmica H1N1. Es van recollir mostres setmanals de hisops nasals dels garrins des de les 3-9 setmanes de vida, i mostres de sang a les 3, 6 i 9 setmanes de vida. En el primer longitudinal abans de la vacunació, es va avaluar la circulació vírica basal en 50 garrins de 4 lots consecutius. En el segon longitudinal, es va realitzar vacunació en llençol de truges usant la vacuna comercial polivalent (grup control) i la meitat d'aquestes van ser revacunades 3 setmanes abans de el part (grup tractament). Es va seleccionar un grup aleatori de 10 truges de cada grup i es va fer el seguiment setmanal de 5 garrins per truja. L'estudi va ser repetit en 4 lots consecutius. En el tercer estudi longitudinal, el procediment va ser el mateix que en l'anterior, però fent servir la vacuna inactivada pandèmica H1N1. Hisops nasals van ser examinats per RT-qPCR i els sèrums van ser analitzats utilitzant un ELISA comercial (CIVTEST ©-Suis Influenza). En el segon longitudinal després de l'aplicació de la primera vacuna, l'inici de la infecció es va retardar en dues setmanes, però no es van observar diferències significatives entre els dos grups; i en el tercer, l'inici de la infecció es va moure cap a l'esquerra en tots els grups, sense diferències significatives entre ells. En els tres estudis, es van detectar animals que excretaron virus en dos o fins a en tres mostrejos consecutius, així com alguns casos de re-infeccions. El llinatge present a la granja durant els dos primers estudis longitudinals es correspon a un H1avN1av. No obstant això, durant el tercer estudi, es va detectar circulant en tots els grups d'animals 1 H3huN2hu que portava un nou llinatge H3 humà derivat d'un virus de la grip estacional humana. |
|---|