Análisis del patrón de expresión de la tolerancia a endotoxinas en un modelo de monocitos humanos mediante RNA-seq
Este trabajo se centra en la respuesta del Sistema Inmune enfocándose en la tolerancia a endotoxinas. Esta se describe como la reprogramación del sistema inmune innato contra las infecciones causadas por patógenos y es uno de los mecanismos de protección más importantes descritos en la biomedicina....
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2019 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/90966 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/90966 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | tolerancia a endotoxinas RNA-seq tolerància a endotoxines endotoxin tolerance Bioinformatics -- TFM Bioinformàtica -- TFM Bioinformática -- TFM |
| Sumario: | Este trabajo se centra en la respuesta del Sistema Inmune enfocándose en la tolerancia a endotoxinas. Esta se describe como la reprogramación del sistema inmune innato contra las infecciones causadas por patógenos y es uno de los mecanismos de protección más importantes descritos en la biomedicina. En este estudio se desarrollaron tres modelos con monocitos/macrófagos humanos, los cuales simulan un donante sano, un paciente inflamado y el estado de tolerancia a endotoxinas. Para realizar un estudio exhaustivo diferencial de los tres estados utilizamos la técnica RNA-seq, ya que ésta cuantifica la presencia de ARN mensajero en una muestra biológica, y la utilizamos para detectar los cambios en el transcriptoma entre condiciones, obteniendo así características específicas y cambios genéticos en la tolerancia a endotoxinas. Una vez desarrollado el análisis, utilizando diversas herramientas informáticas, podemos concluir que se comprueban los diferentes patrones de expresión de cada modelo, aclarando así la independencia de cada estado. Además obtenemos listados de genes de expresión diferencial y sus asociaciones a procesos y funciones biológicas, que pueden ser de gran interés en futuras investigaciones. A parte generamos un listado de inmunocheckpoints asociados al dominio v-set por indicación propia del grupo de investigación, dotándonos de posibles moléculas diana para futuros tratamientos. |
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