Anàlisi de l'expressió gènica de pacients amb Limfoma Plasmablàstic mitjançant dades d'RNA-seq

El limfoma plasmablàstic (LPB) és un subtipus de Limfoma B Difús de Cèl·lula Gran (LBDCG) que s'associa principalment a la infecció pel virus de la immunodeficiència humana (VIH), a altres tipus d'immunodepressió (com els receptors de trasplantament d'òrgans sòlids) i fins i tot en pa...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Méndez López, Aleix
Tipo de recurso: tesis de maestría
Fecha de publicación:2021
País:España
Institución:Universitat Oberta de Catalunya (UOC)
Repositorio:O2, repositorio institucional de la UOC
OAI Identifier:oai:openaccess.uoc.edu:10609/133611
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10609/133611
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:miRNA
RNA-seq
anàlisi d'expressió diferencial
análisis de expresión diferencial
differential expression analysis
Bioinformatics -- TFM
Bioinformàtica -- TFM
Bioinformática -- TFM
Descripción
Sumario:El limfoma plasmablàstic (LPB) és un subtipus de Limfoma B Difús de Cèl·lula Gran (LBDCG) que s'associa principalment a la infecció pel virus de la immunodeficiència humana (VIH), a altres tipus d'immunodepressió (com els receptors de trasplantament d'òrgans sòlids) i fins i tot en pacients immunocompetents. Tot i que és una malaltia rara en general, la incidència augmenta dràsticament en regions amb una prevalença elevada d'VIH. El limfoma plasmablàstic és un tumor poc estudiat i extremadament agressiu. L'aportació d'informació per definir l'expressió genòmica d'aquest limfoma és important per a la comprensió de la patogènesi d'aquesta malaltia. El present treball estudia els canvis en l'expresssió que es generen en el transcriptoma, mitjançant l'anàlisi bioinformàtic de les dades obtingudes a partir de tècniques d'RNA-seq realitzades sobre un conjunt de mostres de pacients amb LPB i Controls sense LPB. A més, gràcies a un estudi d'expressió de microarrays anterior on es van trobar un conjunt de miRNAs diferencialment expressats entre els mateixos dos grups, es determina quin és el paper dels miRNA diferencialment expressats en la modulació de l'expressió dels gens diana als que s'uneix.