Epidemiologia molecular dels brots de gastroenteritis per norovirus i d'hepatitits A: de la seqüència consens a la quasiespècie

Dos dels virus entèrics humans més rellevants en l’àmbit de la salut pública i la seguretat alimentària són els HuNoV, causants de gastroenteritis aguda (GEA) esporàdica i epidèmica, i l’HAV, la principal causa d’hepatitis aguda a nivell mundial. Els HuNoVs afecten a tots els grups d’edat, la seva d...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Sabrià Sunyé, Aurora
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2018
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/666628
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/666628
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Epidemiologia
Epidemiología
Epidemiology
Virus
Viruses
Hepatitis A
Ciències Experimentals i Matemàtiques
578
Descripción
Sumario:Dos dels virus entèrics humans més rellevants en l’àmbit de la salut pública i la seguretat alimentària són els HuNoV, causants de gastroenteritis aguda (GEA) esporàdica i epidèmica, i l’HAV, la principal causa d’hepatitis aguda a nivell mundial. Els HuNoVs afecten a tots els grups d’edat, la seva distribució geogràfica és mundial i degut a la seva elevada variabilitat i ràpida evolució, causen brots epidèmics amb elevada freqüència. En quant a HAV, la infecció sol ser asimptomàtica en nens i la gravetat augmenta amb l’edat, essent Europa una regió de baixa endemicitat. Existeixen varies vacunes inactivades efectives contra HAV i a Catalunya van ser incorporades en el calendari sistemàtic el 1998. Tot i l’efecte beneficiós d’aquesta mesura, recentment a Europa s’ha detectat un augment de brots de gran magnitud tant de transmissió alimentària, com en la població d’homes que tenen sexe amb altres homes (MSM). L’objectiu general plantejat en aquesta tesi ha estat aprofundir en el coneixement de l’epidemiologia i la caracterització molecular de brots causats per HuNoV i per HAV a Catalunya, mitjançant l’anàlisi de les seqüències consens obtingudes per Sanger i de les poblacions víriques, obtingudes per NSG. La tesi està formada per quatre articles. En els dos primers estudis, mitjançant la seqüència consens, s’ha fet l’anàlisi epidemiològic de les soques circulants de HuNoV a la població de Catalunya durant tres anys. De tots els brots de possible etiologia vírica, el 76% van ser deguts a HuNoV, observant-se 15 genotips diferents. A més, es va observar l’aparició de la nova variant de genogrup II genotip 4 (GII.4) i com aquesta reemplaçava l’anterior. En la majoria dels brots estudiats, també es va avaluar el paper dels manipuladors d’aliments (FHs) i dels treballadors sanitaris (HCWs), analitzant la incidència d’infeccions amb o sense símptomes en aquests grups durant l’aparició de brots, i caracteritzant els nivells i la durada d’excreció de HuNoV en femtes. Les taxes d’atac entre FHs i HCWs en escenaris de brot van ser similars, però el percentatge d’infeccions asimptomàtiques va ser significativament major entre els FHs. No es van observar diferències ni en la durada ni en els nivells d’excreció entre individus amb infeccions simptomàtiques i asimptomàtiques. En els altres dos estudis s’ha desenvolupat un protocol de seqüenciació massiva per veure la variabilitat genètica de les quasiespècies circulants, tant de HuNoV com de HAV. Aquests protocols constitueixen una eina excel·lent de cara a la futura caracterització de brots, ja que en poc temps permet obtenir informació de les variants virals que circulen a la població. En general, es va observar que la diversitat viral és força específica d’individu i, en l’estudi de HuNoV vam observar major diversitat en els individus asimptomàtics, suggerint que aquests també poden contribuir a l’expansió de les variants minoritàries si presenten avantatges. En l’estudi d’HAV es van caracteritzar les quasiespècies circulants en el brot MSM 2016-2017 de casos de Barcelona, on es va veure una pressió selectiva de les variants antigèniques en individus vacunats. Veient que en els últims anys els casos d’HAV entre els MSM estan en alça, una bona pauta de vacunació és necessària per evitar el màxim possible l’emergència de variants d’escapament a la vacuna.

Similares en LA Referencia