Building Trust in Variant Interpretation: A Framework for Transparency and Reproducibility

[ES] La práctica de la medicina ha experimentado un cambio de paradigma hacia un enfoque de precisión, donde los tratamientos se adaptan no a la población promedio, sino a cada paciente basándose en su combinación única de ADN, estilo de vida y entorno. Un aspecto fundamental de este enfoque es la i...

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Detalles Bibliográficos
Autor: Costa-Sánchez, Mireia|||0000-0002-8614-0914
Tipo de recurso: tesis doctoral
Fecha de publicación:2025
País:España
Institución:Universitat Politècnica de València (UPV)
Repositorio:RiuNet. Repositorio Institucional de la Universitat Politécnica de Valéncia
Idioma:inglés
OAI Identifier:oai:riunet.upv.es:10251/230994
Acceso en línea:https://riunet.upv.es/handle/10251/230994
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Variant interpretation
Precision Medicine
Transparency
Reproducibility
Conceptual Modeling
03.- Garantizar una vida saludable y promover el bienestar para todos y todas en todas las edades
09.- Desarrollar infraestructuras resilientes, promover la industrialización inclusiva y sostenible, y fomentar la innovación
Descripción
Sumario:[ES] La práctica de la medicina ha experimentado un cambio de paradigma hacia un enfoque de precisión, donde los tratamientos se adaptan no a la población promedio, sino a cada paciente basándose en su combinación única de ADN, estilo de vida y entorno. Un aspecto fundamental de este enfoque es la interpretación de variantes, que consiste en determinar el efecto de una variante del ADN en la salud humana y, en última instancia, cuantificar su impacto en el desarrollo de enfermedades. Sin embargo, la implementación rutinaria de la interpretación de variantes se ve obstaculizada por las persistentes discrepancias entre los expertos. Estos conflictos surgen del desafío inherente de aplicar guías de interpretación ambiguas a conocimiento vasto, heterogéneo y en rápida evolución. En consecuencia, la información precisa, los criterios y el contexto temporal de la interpretación suelen permanecer opacos. Dicha falta de transparencia compromete la reproducibilidad y, en última instancia, socava la confianza en los resultados de la interpretación. Esta tesis aborda la problemática falta de transparencia y reproducibilidad a través de un novedoso marco estructurado en dos partes clave. En primer lugar, desglosa la interpretación mediante la definición y formalización precisa de sus constructos centrales -que abarcan tanto la evidencia utilizada como los criterios aplicados- para sentar las bases de la transparencia. En segundo lugar, sistematiza la interpretación utilizando dichos constructos como base de un método con herramientas automatizadas para garantizar la reproducibilidad. El éxito en el desglose y la sistematización de la interpretación de variantes no sólo mejorará su fiabilidad general, sino que también allanará el camino hacia diagnósticos más precisos, tratamientos personalizados y un progreso acelerado en la medicina.