Bioinformática de plásmidos y dos aplicaciones en biotecnología
Los plásmidos, como Elementos Genéticos Móviles, son una de las fuerzas clave que moldean la evolución de las bacterias a corto plazo. Esta capacidad, que es la que está detrás de la explosión de resistencias a antimicrobianos de las últimas décadas, también puede ser coaptada para proporcionar cara...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Fecha de publicación: | 2023 |
| País: | España |
| Institución: | Universidad de Cantabria (UC) |
| Repositorio: | UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria |
| Idioma: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:repositorio.unican.es:10902/32400 |
| Acceso en línea: | https://hdl.handle.net/10902/32400 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Biotecnología Bioinformática Genómica bacteriana Plásmido Clasificación de plásmidos PTU Unidad Taxonómica Plasmídica Plasmidoma Xylella fastidiosa Erwiniaceae Pantoea Biotechnology Bioinformatics Bacterial genomics Plasmid Plasmid classification Plasmid Taxonomic Unit Plasmidome |
| Sumario: | Los plásmidos, como Elementos Genéticos Móviles, son una de las fuerzas clave que moldean la evolución de las bacterias a corto plazo. Esta capacidad, que es la que está detrás de la explosión de resistencias a antimicrobianos de las últimas décadas, también puede ser coaptada para proporcionar características deseables a bacterias de interés biotecnológico. Este trabajo describe una serie de herramientas bioinformáticas para el estudio de plásmidos, entre las que destaca un novedoso método de clasificación basado en el concepto de PTU (Unidad Taxonómica Plasmídica) equivalente al de especie bacteriana. El uso de estas herramientas se ejemplifica con la descripción de dos plasmidomas de interés agrotecnológico: el plasmidoma de Xylella fastidiosa, por la reciente alarma sanitaria de este fitopatógeno en la zona mediterranea, y el plasmidoma de la familia Erwiniaceae, a la que pertenece el género Pantoea y portado habitualmente por las semillas del trigo. Estudios recientes relacionan capacidades bioestimulantes con los plásmidos de Pantoea, abriendo su uso para aplicaciones agrotecnológicas. |
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