A Multi-Omics Approach to Unravel the Epigenetic and Topological Mechanisms Underlying Colorectal Tumorigenesis

La transcripció, a més d'estar modulada per factors de transcripció, activadors i repressors, entre d'altres, està regulada per una interacció dinàmica i complexa de capes epigenètiques, que inclouen l'accessibilitat a la cromatina, les modificacions de les histones i l'organitza...

ver descrição completa

Detalhes bibliográficos
Autor: Novillo Font, Meritxell
Formato: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2025
País:España
Recursos:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/696032
Acesso em linha:http://hdl.handle.net/10803/696032
Access Level:acceso embargado
Palavra-chave:Epigenètica
Epigenetics
Epigenética
Càncer colorectal
Colorectal cancer
Cáncer colorrectal
Organoids
Organoides
Topologia del genoma
Genome topology
Topología del genoma
Mutacions
Mutations
Mutaciones
616.3
Descrição
Resumo:La transcripció, a més d'estar modulada per factors de transcripció, activadors i repressors, entre d'altres, està regulada per una interacció dinàmica i complexa de capes epigenètiques, que inclouen l'accessibilitat a la cromatina, les modificacions de les histones i l'organització tridimensional del genoma. Tanmateix, la mesura en què aquestes capes contribueixen al càncer colorectal (CCR) encara no s'ha caracteritzat prou. L'objectiu d'aquesta Tesi Doctoral és integrar la topologia espacial del genoma amb l'expressió gènica i capes òmiques addicionals (ATAC-seq i CUT&RUN per a H3K27ac i H3K27me3) en organoides de còlon de ratolí sans i en organoides que porten les mutacions més freqüents en pacients amb CCR (Apc, Trp53, Smad4 i Kras). Aquest enfocament busca proporcionar nous coneixements biològics sobre com els mecanismes epigenètics impulsen la regulació transcripcional en el context del CCR.