Chromatin reorganization during epithelial-to-mesenchymal transition : a role for euchromatin lamin B1 domains

Les làmines nuclears (A/C i B) són els majors constituents de la làmina nuclear (NL). Els estructuralment conservats dominis associats a les làmines (LADs) estan formats per regions genòmiques que contacten amb la NL. Tot i així, les làmines també s’han trobat dins del nucleoplasma però el paper de...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Pascual-Reguant, Laura
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2018
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/665366
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/665366
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Chromatina
Lamin B1
Reorganització
Transició Epiteli-Mesènquima
Estructura de la cromatina
Chromatin
Reorganization
Epithelial-to-Mesenchymal Transition
Chromatin structure
576
Descripción
Sumario:Les làmines nuclears (A/C i B) són els majors constituents de la làmina nuclear (NL). Els estructuralment conservats dominis associats a les làmines (LADs) estan formats per regions genòmiques que contacten amb la NL. Tot i així, les làmines també s’han trobat dins del nucleoplasma però el paper de les làmines nuceloplasmàtiques encara està per definir. En aquesta tesis, hem mapat la localització de la Lamina B1 en tot el genoma de ratolí en una fracció enriquida en eucromatina i hem seguit el seu dinamisme durant la transició epiteli-mesènquima (EMT). La lamina B1 s’associa amb eucromatina activament expressada i oberta, formant dominis d’eucromatina associats a la lamina B1 (eLADs) dinàmics amb una mida mitjana de 0.3Mb. Les dades del Hi-C relacionen els eLADs amb la organització tri-dimensional del genoma de ratolí durant el procés de transició epiteli-mesènquima i correlaciona l’enriquiment de la lamina B1 a les fronteres de dominis d’associació topològics (TADs) amb un increment de la força de les fronteres. Nivells reduïts de lamina B1 alteren el la EMT i comprometen l’adquisició de característiques mesenquimals. Per tant, el genoma de ratolí necessita de dominis plàstics i dinàmics (eLADs) que continguin nivells predeterminats de lamina B1 per tal que es completi la EMT.