Modelado integrativo de la estructura 3D de macromoléculas
El estudio de la estructura de las biomoléculas es fundamental para entender la vida desde un punto de vista molecular. Los métodos directos usados para resolver la estructura de complejos macromoleculares, como la cristalografía de rayos X, están llegando a su límite y el futuro se está abriendo pa...
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Fecha de publicación: | 2018 |
| País: | España |
| Institución: | Universidad Complutense de Madrid (UCM) |
| Repositorio: | Docta Complutense |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:docta.ucm.es:20.500.14352/16707 |
| Acceso en línea: | https://hdl.handle.net/20.500.14352/16707 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | 577.112(043.2) 577.2 (043.2) Proteínas biomoléculas Proteins biomolecules Biología molecular (Biología) 2415 Biología Molecular |
| Sumario: | El estudio de la estructura de las biomoléculas es fundamental para entender la vida desde un punto de vista molecular. Los métodos directos usados para resolver la estructura de complejos macromoleculares, como la cristalografía de rayos X, están llegando a su límite y el futuro se está abriendo paso para resolver dichas estructuras mediante la integración de datos provenientes de distintas técnicas.El objetivo de esta Tesis ha sido desarrollar métodos integrativos para resolver estructuras de complejos macromoleculares. Se han desarrollado dos métodos, uno dirigido a determinar la conformación de complejos multiproteicos y otro para inferir la estructura de la cromatina de distintas regiones del genoma.El primer método se utilizó para resolver la arquitectura del exocyst, un complejo multiproteico compuesto por 8 proteínas de forma alargada, responsable de fusionar vesículas secretoras a la membrana plasmática. El exocyst ha sido difícil de purificar hasta ahora, y, por ello, ha sido difícil resolver su estructura atómica mediante técnicas convencionales como cristalografía de rayos X o resonancia magnética nuclear. El método combina la información estructural de cada subunidad con las distancias entre ellas obtenidas mediante microscopía óptica. Estas distancias, medidas entre distintos fluoróforos fusionados a los extremos amino y carboxilo terminal de cada subunidad, se usan como restricciones espaciales para resolver la estructura. Nuestra herramienta, gracias a algoritmos optimizadores, genera modelos tridimensionales (3D) del exocyst que cumplen las restricciones impuestas. Mediante el análisis de la población de los mejores modelos, se propuso un modelo representativo... |
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