Determinación del perfil de la enzima óxido nítrico reductasa
El objetivo del proyecto fue establecer el perfil (o perfiles) de la enzima óxido nítrico reductasa (nor) ya que los perfiles disponibles actualmente no son adecuados, y la obtención de perfiles con capacidad discriminante permitirían generar nuevos conocimientos para identificar la enzima en genoma...
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| Tipo de documento: | dissertação |
| Data de publicação: | 2021 |
| País: | España |
| Recursos: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositório: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/138314 |
| Acesso em linha: | http://hdl.handle.net/10609/138314 |
| Access Level: | Acceso aberto |
| Palavra-chave: | óxido nítrico reductasa filogenia bioinformática òxid nítric reductasa bioinformàtica filogènia nitric oxide reductase bioinformatics phylogeny Nitric oxide -- TFM Òxid nítric -- TFM Óxido nítrico -- TFM |
| Resumo: | El objetivo del proyecto fue establecer el perfil (o perfiles) de la enzima óxido nítrico reductasa (nor) ya que los perfiles disponibles actualmente no son adecuados, y la obtención de perfiles con capacidad discriminante permitirían generar nuevos conocimientos para identificar la enzima en genomas ya secuenciados o en secuencias obtenidas de novo, obtener nuevas cepas bacterianas con propiedades interesantes para su uso en agricultura y medio ambiente, o para estudios de biodiversidad, que darán lugar a nuevos conocimientos en relación a la nor, y permitirá a la comunidad científica adquirir una mayor comprensión de los mecanismos de desnitrificación, lo que en último lugar permitirá desarrollar estrategias viables para reducir las emisiones de N2O. El enfoque y metodología propuestos en este proyecto para cumplir con los objetivos del proyecto, está basado en los trabajos realizados Udaondo y col. y éstos se basan en aprovechar la gran cantidad de información disponible existente (secuencias) para establecer el perfil de la enzima mediante la construcción o elaboración de perfiles generalizados PROSITE. En el árbol filogenético se observaron tres tipos de nor (cNOR, vNOR, qNOR+qCuNOR) que se corresponden con la literatura. Se observó que los perfiles generalizados obtenidos para cada clase de nor tenían capacidad para identificar y discriminar entre tipos de nor en el genoma de un organismo e igualmente identificar la proteína en bases de datos se secuencias no anotadas. Sin embargo, no se pudo realizar una validación más exhaustiva por lo que se considera necesario realizar más trabajos en un futuro. |
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