Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma

Adrenal gland diseases; Cancer genomics; Prognostic markers

Bibliographic Details
Authors: Martínez-Montes, Ángel M., Fernández-Sanromán, Ángel, Lopez Fernandez, Adrià, De Almeida Toledo, Rodrigo, Caleiras, Eduardo, Calsina, Bruna, Piñeiro-Yáñez, Elena, Monteagudo, María
Format: article
Status:Published version
Publication Date:2023
Country:España
Institution:Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya (DS)
Repository:Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salut
OAI Identifier:oai:scientiasalut.gencat.cat:11351/9205
Online Access:https://hdl.handle.net/11351/9205
Access Level:Open access
Keyword:Genòmica
Tumors neuroendocrins - Aspectes genètics
Metàstasi
DISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma::Pheochromocytoma
DISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma
PHENOMENA AND PROCESSES::Cell Physiological Phenomena::Cellular Microenvironment::Tumor Microenvironment
DISCIPLINES AND OCCUPATIONS::Natural Science Disciplines::Biological Science Disciplines::Biology::Computational Biology::Genomics
ENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma::feocromocitoma
ENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma
FENÓMENOS Y PROCESOS::fenómenos fisiológicos celulares::microambiente celular::microambiente tumoral
DISCIPLINAS Y OCUPACIONES::disciplinas de las ciencias naturales::disciplinas de las ciencias biológicas::biología::biología computacional::genómica
id ES_7dde970a62518cae52d09b200dcfb939
oai_identifier_str oai:scientiasalut.gencat.cat:11351/9205
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
title Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
spellingShingle Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
Martínez-Montes, Ángel M.
Genòmica
Tumors neuroendocrins - Aspectes genètics
Metàstasi
DISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma::Pheochromocytoma
DISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma
PHENOMENA AND PROCESSES::Cell Physiological Phenomena::Cellular Microenvironment::Tumor Microenvironment
DISCIPLINES AND OCCUPATIONS::Natural Science Disciplines::Biological Science Disciplines::Biology::Computational Biology::Genomics
ENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma::feocromocitoma
ENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma
FENÓMENOS Y PROCESOS::fenómenos fisiológicos celulares::microambiente celular::microambiente tumoral
DISCIPLINAS Y OCUPACIONES::disciplinas de las ciencias naturales::disciplinas de las ciencias biológicas::biología::biología computacional::genómica
title_short Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
title_full Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
title_fullStr Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
title_full_unstemmed Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
title_sort Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma
dc.creator.none.fl_str_mv Martínez-Montes, Ángel M.
Fernández-Sanromán, Ángel
Lopez Fernandez, Adrià
De Almeida Toledo, Rodrigo
Caleiras, Eduardo
Calsina, Bruna
Piñeiro-Yáñez, Elena
Monteagudo, María
author Martínez-Montes, Ángel M.
author_facet Martínez-Montes, Ángel M.
Fernández-Sanromán, Ángel
Lopez Fernandez, Adrià
De Almeida Toledo, Rodrigo
Caleiras, Eduardo
Calsina, Bruna
Piñeiro-Yáñez, Elena
Monteagudo, María
author_role author
author2 Fernández-Sanromán, Ángel
Lopez Fernandez, Adrià
De Almeida Toledo, Rodrigo
Caleiras, Eduardo
Calsina, Bruna
Piñeiro-Yáñez, Elena
Monteagudo, María
author2_role author
author
author
author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Institut Català de la Salut
[Calsina B, Martínez-Montes ÁM, Fernández-Sanromán Á, Monteagudo M] Hereditary Endocrine Cancer Group, Human Cancer Genetics Program, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain. [Piñeiro-Yáñez E] Bioinformatics Unit, Structural Biology Program, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain. [Caleiras E] Histopathology Core Unit, Biotechnology Program, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain. [López-Fernández A] Servei d’Oncologia Mèdica, Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. [Toledo RA] Gastrointestinal and Endocrine Tumors, Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), Institute of Health Carlos III (ISCIII), Madrid, Spain
Vall d'Hebron Barcelona Hospital Campus
dc.subject.none.fl_str_mv Genòmica
Tumors neuroendocrins - Aspectes genètics
Metàstasi
DISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma::Pheochromocytoma
DISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma
PHENOMENA AND PROCESSES::Cell Physiological Phenomena::Cellular Microenvironment::Tumor Microenvironment
DISCIPLINES AND OCCUPATIONS::Natural Science Disciplines::Biological Science Disciplines::Biology::Computational Biology::Genomics
ENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma::feocromocitoma
ENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma
FENÓMENOS Y PROCESOS::fenómenos fisiológicos celulares::microambiente celular::microambiente tumoral
DISCIPLINAS Y OCUPACIONES::disciplinas de las ciencias naturales::disciplinas de las ciencias biológicas::biología::biología computacional::genómica
topic Genòmica
Tumors neuroendocrins - Aspectes genètics
Metàstasi
DISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma::Pheochromocytoma
DISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma
PHENOMENA AND PROCESSES::Cell Physiological Phenomena::Cellular Microenvironment::Tumor Microenvironment
DISCIPLINES AND OCCUPATIONS::Natural Science Disciplines::Biological Science Disciplines::Biology::Computational Biology::Genomics
ENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma::feocromocitoma
ENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma
FENÓMENOS Y PROCESOS::fenómenos fisiológicos celulares::microambiente celular::microambiente tumoral
DISCIPLINAS Y OCUPACIONES::disciplinas de las ciencias naturales::disciplinas de las ciencias biológicas::biología::biología computacional::genómica
description Adrenal gland diseases; Cancer genomics; Prognostic markers
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023
2023
2023
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/11351/9205
url https://hdl.handle.net/11351/9205
dc.language.none.fl_str_mv Inglés
language_invalid_str_mv Inglés
dc.relation.none.fl_str_mv Nature Communications;14
https://doi.org/10.1038/s41467-023-36769-6
dc.rights.none.fl_str_mv Attribution 4.0 International
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution 4.0 International
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Nature Portfolio
publisher.none.fl_str_mv Nature Portfolio
dc.source.none.fl_str_mv Scientia
reponame:Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salut
instname:Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya (DS)
instname_str Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya (DS)
reponame_str Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salut
collection Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salut
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869411695154167808
spelling Genomic and immune landscape Of metastatic pheochromocytoma and paragangliomaMartínez-Montes, Ángel M.Fernández-Sanromán, ÁngelLopez Fernandez, AdriàDe Almeida Toledo, RodrigoCaleiras, EduardoCalsina, BrunaPiñeiro-Yáñez, ElenaMonteagudo, MaríaGenòmicaTumors neuroendocrins - Aspectes genèticsMetàstasiDISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::Paraganglioma::PheochromocytomaDISEASES::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Neoplasms, Germ Cell and Embryonal::Neuroectodermal Tumors::Neuroendocrine Tumors::ParagangliomaPHENOMENA AND PROCESSES::Cell Physiological Phenomena::Cellular Microenvironment::Tumor MicroenvironmentDISCIPLINES AND OCCUPATIONS::Natural Science Disciplines::Biological Science Disciplines::Biology::Computational Biology::GenomicsENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paraganglioma::feocromocitomaENFERMEDADES::neoplasias::neoplasias por tipo histológico::neoplasias de células germinales y embrionarias::tumores neuroectodérmicos::tumores neuroendocrinos::paragangliomaFENÓMENOS Y PROCESOS::fenómenos fisiológicos celulares::microambiente celular::microambiente tumoralDISCIPLINAS Y OCUPACIONES::disciplinas de las ciencias naturales::disciplinas de las ciencias biológicas::biología::biología computacional::genómicaAdrenal gland diseases; Cancer genomics; Prognostic markersMalalties de les glàndules suprarenals; Genòmica del càncer; Marcadors pronòsticsEnfermedades de las glándulas suprarrenales; Genómica del cáncer; Marcadores pronósticosThe mechanisms triggering metastasis in pheochromocytoma/paraganglioma are unknown, hindering therapeutic options for patients with metastatic tumors (mPPGL). Herein we show by genomic profiling of a large cohort of mPPGLs that high mutational load, microsatellite instability and somatic copy-number alteration burden are associated with ATRX/TERT alterations and are suitable prognostic markers. Transcriptomic analysis defines the signaling networks involved in the acquisition of metastatic competence and establishes a gene signature related to mPPGLs, highlighting CDK1 as an additional mPPGL marker. Immunogenomics accompanied by immunohistochemistry identifies a heterogeneous ecosystem at the tumor microenvironment level, linked to the genomic subtype and tumor behavior. Specifically, we define a general immunosuppressive microenvironment in mPPGLs, the exception being PD-L1 expressing MAML3-related tumors. Our study reveals canonical markers for risk of metastasis, and suggests the usefulness of including immune parameters in clinical management for PPGL prognostication and identification of patients who might benefit from immunotherapy.This work was supported by Project PI17/01796 and PI20/01169 to M.R. [Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Acción Estratégica en Salud, cofinanciado a través del Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER)], Paradifference Foundation [no grant number applicable to M.R.], Pheipas Association [no grant number applicable to M.R.], the Clinical Research Priority Program of the University of Zurich for the CRPP HYRENE to F.B., the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) within the CRC/Transregio 205/1 (Project No. 314061271-TRR205 to to F.B., M.F., N.B., and G.E.) and the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Spanish Ministry of Science and Innovation (Project No. PID2019-111356RA-I00 to G.M.). B.C. was supported by the Rafael del Pino Foundation (Becas de Excelencia Rafael del Pino 2017). A.M.M.-M. was supported by CAM (S2017/BMD-3724; TIRONET2-CM). A.F.-S. and J.L. received the support of a fellowship from La Caixa Foundation (ID 100010434; LCF/BQ/DR21/11880009 and LCF/BQ/DR19/11740015, respectively). M.M., S.M., and M.S. were supported by the Spanish Ministry of Science, Innovation and Universities “Formación del Profesorado Universitario— FPU” fellowship with ID number FPU18/00064, FPU19/04940 and FPU16/05527. A.D.-T. is supported by the Centro de Investigacion Biomédica en Red de Enfermedades Raras (CIBERER). L.J.L.-G. was supported both by the Banco Santander Foundation and La Caixa Postdoctoral Junior Leader Fellowship (LCF/BQ/PI20/11760011). C.M.-C. was supported by a grant from the AECC Foundation (AIO15152858 MONT). We thank the Spanish National Tumor Bank Network (RD09/0076/00047) for the support in obtaining tumorsamples and all patients, physicians and tumor biobanks involved in the study.Nature PortfolioInstitut Català de la Salut[Calsina B, Martínez-Montes ÁM, Fernández-Sanromán Á, Monteagudo M] Hereditary Endocrine Cancer Group, Human Cancer Genetics Program, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain. [Piñeiro-Yáñez E] Bioinformatics Unit, Structural Biology Program, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain. [Caleiras E] Histopathology Core Unit, Biotechnology Program, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid, Spain. [López-Fernández A] Servei d’Oncologia Mèdica, Vall d’Hebron Hospital Universitari, Barcelona, Spain. [Toledo RA] Gastrointestinal and Endocrine Tumors, Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona, Spain. Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), Institute of Health Carlos III (ISCIII), Madrid, SpainVall d'Hebron Barcelona Hospital Campus202320232023info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/11351/9205Scientiareponame:Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salutinstname:Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya (DS)InglésNature Communications;14https://doi.org/10.1038/s41467-023-36769-6Attribution 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessoai:scientiasalut.gencat.cat:11351/92052026-06-12T09:38:37Z
score 15,811543

Similar Items