Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV

En els darrers anys, l'ús dels fluids orals (FO) com a mostra diagnòstica en el control i monitoratge del Virus de la síndrome reproductiva i respiratòria porcina (PRRSV) s'ha estès en gran mesura per l'Amèrica del Nord i de manera més discreta per Europa. Tanmateix, no existeixen gai...

ver descrição completa

Detalhes bibliográficos
Autor: Gibert Rebull, Elisa
Formato: tesis doctoral
Fecha de publicación:2017
País:España
Recursos:Universitat Autònoma de Barcelona
Repositorio:Dipòsit Digital de Documents de la UAB
Idioma:catalán
OAI Identifier:oai:ddd.uab.cat:180103
Acesso em linha:https://ddd.uab.cat/record/180103
Access Level:acceso abierto
Palavra-chave:Síndrome respiratori i reproductiu porcí
Porcs
Líquids orgànics
id ES_7bee0c845000174b3841ac0cefa0e65d
oai_identifier_str oai:ddd.uab.cat:180103
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV
title Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV
spellingShingle Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV
Gibert Rebull, Elisa
Síndrome respiratori i reproductiu porcí
Porcs
Porcs
Líquids orgànics
title_short Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV
title_full Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV
title_fullStr Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV
title_full_unstemmed Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV
title_sort Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV
dc.creator.none.fl_str_mv Gibert Rebull, Elisa
author Gibert Rebull, Elisa
author_facet Gibert Rebull, Elisa
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals
Mateu de Antonio, Enrique María
dc.subject.none.fl_str_mv Síndrome respiratori i reproductiu porcí
Porcs
Porcs
Líquids orgànics
topic Síndrome respiratori i reproductiu porcí
Porcs
Porcs
Líquids orgànics
description En els darrers anys, l'ús dels fluids orals (FO) com a mostra diagnòstica en el control i monitoratge del Virus de la síndrome reproductiva i respiratòria porcina (PRRSV) s'ha estès en gran mesura per l'Amèrica del Nord i de manera més discreta per Europa. Tanmateix, no existeixen gaires estudis sobre els límits de detecció de la tècnica en el monitoratge de la malaltia en granges infectades amb el PRRSV1. Per aquesta raó l'objectiu de la present tesi va ser avaluar l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV1, determinant els factors que influeixen en la seva eficàcia diagnòstica. L'objectiu del primer estudi va ser l'avaluació de l'excreció individual en FO del PRRSV1 al llarg del temps, en animals inoculats, infectats per contacte i infectats vacunats. Paral·lelament, es va valorar la sensibilitat en la detecció de l'excreció del virus en els FO per PCR quantitativa, prenent com a referència la virèmia. Els animals inoculats i infectats per contacte van mostrar un patró d'excreció en FO semblant, en canvi el patró dels animals vacunats va ser més inconstant. En els animals vacunats també es va produir una reducció significativa del període d'excreció (P 0.68 en tots els casos. L'objectiu del segon estudi era identificar i valorar les pèrdues d'eficiència que es podrien donar durant el procés d'anàlisi de les mostres de FO per qRT-PCR: efecte de les diferents matrius per la recollida de les mostres, el temps i la temperatura fins a la seva anàlisi, les condicions de conservació, l'efecte de la centrifugació, de diferents mètodes d'extracció de l'RNA i dels reactius per la PCR. Es van utilitzar FO lliures de PRRSV infectats amb concentracions conegudes del virus. No es van trobar diferències entre les matrius de recol·lecció ni els mètodes de conservació dels FO. En canvi, es va observar una menor sensibilitat analítica (P 0.05) en les mostres mantingudes durant 72h a 4ᵒC. En les dilucions límit, la centrifugació a 15.000 g va produir un augment significatiu en la sensibilitat de les mostres (P 0.05). Els mètodes d'extracció amb majors eficiències van ser el TRIzol®, el MagMAX™ i el NuceoSpin®. En dilucions de FO iguals, el kit de qRT-PCR LSI VetMAX® va donar menors Cts que l'AgPath™. En el tercer estudi, a partir de la bibliografia existent i les dades obtingudes en els experiments anteriors, es va elaborar un càlcul de probabilitats per determinar els límits de la detecció del PRRSV1 en FO quan s'usa en granges amb baixes prevalences. Es van comparar diversos tipus de granges d'acord amb l'estructura de les maternitats, de les transicions i la mida del mostreig. Segons els resultats obtinguts, els factors determinants de la detecció del PRRSV van ser la incidència dels esdeveniments verticals, el nombre de truges en producció, la mida dels corrals de transició, així com el nombre de corrals analitzats. La qRT-PCR va ser capaç de detectar el virus en els FO en la majoria d'escenaris possibles, fins i tot quan es tenia un sol animal infectat en corrals de 50 o menys animals. En la majoria de casos, incidències de parts amb animals virèmics inferiors al 5% en granges de 1.000 o menys truges, feien que la presència d'animals infectats en els corrals de transició fos un fenomen rar, i la seva detecció depengués més del nombre de corrals mostrejats que de qualsevol altra circumstància. Com a conclusió, els resultats de la present tesi estableixen un protocol que maximitza la sensibilitat en la detecció del PRRSV1 en FO i en demostren la seva validesa en transicions amb baixes prevalences.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2
2017-01-01
2017
2017-01-01
dc.type.none.fl_str_mv Tesi doctoral
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
VoR
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.openaire.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
dc.identifier.none.fl_str_mv https://ddd.uab.cat/record/180103
url https://ddd.uab.cat/record/180103
dc.language.none.fl_str_mv Catalán
cat
language_invalid_str_mv Catalán
language cat
dc.rights.none.fl_str_mv open access
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/
dc.rights.openaire.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv open access
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Dipòsit Digital de Documents de la UAB
instname:Universitat Autònoma de Barcelona
instname_str Universitat Autònoma de Barcelona
reponame_str Dipòsit Digital de Documents de la UAB
collection Dipòsit Digital de Documents de la UAB
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869411552234307584
spelling Avaluació de l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSVGibert Rebull, ElisaSíndrome respiratori i reproductiu porcíPorcsPorcsLíquids orgànicsEn els darrers anys, l'ús dels fluids orals (FO) com a mostra diagnòstica en el control i monitoratge del Virus de la síndrome reproductiva i respiratòria porcina (PRRSV) s'ha estès en gran mesura per l'Amèrica del Nord i de manera més discreta per Europa. Tanmateix, no existeixen gaires estudis sobre els límits de detecció de la tècnica en el monitoratge de la malaltia en granges infectades amb el PRRSV1. Per aquesta raó l'objectiu de la present tesi va ser avaluar l'eficiència de l'ús dels fluids orals en el diagnòstic del PRRSV1, determinant els factors que influeixen en la seva eficàcia diagnòstica. L'objectiu del primer estudi va ser l'avaluació de l'excreció individual en FO del PRRSV1 al llarg del temps, en animals inoculats, infectats per contacte i infectats vacunats. Paral·lelament, es va valorar la sensibilitat en la detecció de l'excreció del virus en els FO per PCR quantitativa, prenent com a referència la virèmia. Els animals inoculats i infectats per contacte van mostrar un patró d'excreció en FO semblant, en canvi el patró dels animals vacunats va ser més inconstant. En els animals vacunats també es va produir una reducció significativa del període d'excreció (P 0.68 en tots els casos. L'objectiu del segon estudi era identificar i valorar les pèrdues d'eficiència que es podrien donar durant el procés d'anàlisi de les mostres de FO per qRT-PCR: efecte de les diferents matrius per la recollida de les mostres, el temps i la temperatura fins a la seva anàlisi, les condicions de conservació, l'efecte de la centrifugació, de diferents mètodes d'extracció de l'RNA i dels reactius per la PCR. Es van utilitzar FO lliures de PRRSV infectats amb concentracions conegudes del virus. No es van trobar diferències entre les matrius de recol·lecció ni els mètodes de conservació dels FO. En canvi, es va observar una menor sensibilitat analítica (P 0.05) en les mostres mantingudes durant 72h a 4ᵒC. En les dilucions límit, la centrifugació a 15.000 g va produir un augment significatiu en la sensibilitat de les mostres (P 0.05). Els mètodes d'extracció amb majors eficiències van ser el TRIzol®, el MagMAX™ i el NuceoSpin®. En dilucions de FO iguals, el kit de qRT-PCR LSI VetMAX® va donar menors Cts que l'AgPath™. En el tercer estudi, a partir de la bibliografia existent i les dades obtingudes en els experiments anteriors, es va elaborar un càlcul de probabilitats per determinar els límits de la detecció del PRRSV1 en FO quan s'usa en granges amb baixes prevalences. Es van comparar diversos tipus de granges d'acord amb l'estructura de les maternitats, de les transicions i la mida del mostreig. Segons els resultats obtinguts, els factors determinants de la detecció del PRRSV van ser la incidència dels esdeveniments verticals, el nombre de truges en producció, la mida dels corrals de transició, així com el nombre de corrals analitzats. La qRT-PCR va ser capaç de detectar el virus en els FO en la majoria d'escenaris possibles, fins i tot quan es tenia un sol animal infectat en corrals de 50 o menys animals. En la majoria de casos, incidències de parts amb animals virèmics inferiors al 5% en granges de 1.000 o menys truges, feien que la presència d'animals infectats en els corrals de transició fos un fenomen rar, i la seva detecció depengués més del nombre de corrals mostrejats que de qualsevol altra circumstància. Com a conclusió, els resultats de la present tesi estableixen un protocol que maximitza la sensibilitat en la detecció del PRRSV1 en FO i en demostren la seva validesa en transicions amb baixes prevalences.Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia AnimalsMateu de Antonio, Enrique María 22017-01-0120172017-01-01Tesi doctoralhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06VoRhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://ddd.uab.cat/record/180103reponame:Dipòsit Digital de Documents de la UABinstname:Universitat Autònoma de BarcelonaCataláncatopen accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/info:eu-repo/semantics/openAccessoai:ddd.uab.cat:1801032026-06-06T12:50:31Z
score 15,301603

Registos relacionados