Micro-epidemiology of PRRS virus infection in vaccinated endemic farms

La present tesi té com a objectiu aprofundir en la comprensió de la dinàmica evolutiva del virus del síndrome reproductiu i respiratori porcí (acrònim en anglès, PRRSV) en el context de granges que implementen vacunació. Mitjançant tres estudis, s'esclareix l'evolució del virus en diversos...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Clilverd Maymo, Hepzibar
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2024
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/691715
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/691715
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:PRRSV
Endèmic
Endemic
Endémico
Vacunació
Vaccination
Vacunación
Ciències de la Salut
619
Descripción
Sumario:La present tesi té com a objectiu aprofundir en la comprensió de la dinàmica evolutiva del virus del síndrome reproductiu i respiratori porcí (acrònim en anglès, PRRSV) en el context de granges que implementen vacunació. Mitjançant tres estudis, s'esclareix l'evolució del virus en diversos escenaris relacionats amb la infecció. El primer estudi es centra en l'impacte immediat d'un brot de PRRSV en una granja que aplica vacunació. Al llarg d'un any, es van monitorar els garrins des del naixement fins a les nou setmanes d'edat per examinar el seu estat de PRRSV mitjançant RT-qPCR i anàlisis serològics, juntament amb seqüenciació (genoma complet, nsp2, nsp9 i ORF5), analitzant en detall la dinàmica del virus durant el període postbrot. Els resultats van mostrar que la diversitat genètica inicial del virus va ser generada principalment per la transmissió vertical, amb una variant que finalment va prevaldre amb el temps. A més, els resultats de l'estudi suggereixen que les truges no responsives i els superdisseminadors poden jugar un paper significatiu en la transmissió de PRRSV. El segon estudi abraça un període d'observació de dos anys en una granja que vacunava contra el PRRSV i que romania endèmica des de feia temps. Com en el primer estudi, es van seguir els garrins des del naixement fins a les nou setmanes d'edat per explorar l'evolució de la infecció. Mitjançant la seqüenciació de ORF5 i genoma complet, es va explorar l'emergència d'una variant viral i la introducció lateral d'una nova soca. Es va realitzar una anàlisi detallada de les variants virals amb la finalitat d'identificar els factors que contribueixen a la seva emergència, incloent aspectes com la cinètica de replicació, l'evasió de neutralització, la capacitat d'adherència a macròfags i la inhibició de la resposta d'interferó. Els resultats van destacar la substitució abrupta d'una variant viral per una altra i van revelar que l'emergència d'una variant viral, amb només vint-i-cinc diferències d'aminoàcids en el genoma complet, pot provocar un augment de la incidència similar al provocat per una nova soca amb un 20% de diferència nucleotídica respecte a l'anterior. Els factors clau que van propiciar la predominança d'aquestes variants van ser la seva habilitat per evadir la neutralització i una capacitat millorada per infectar macròfags. El tercer estudi va investigar la dinàmica d'evolució i persistència del PRRSV en una granja endèmica i vacunada que s'apropava a l'estabilització. De la mateixa manera, es van seguir els porquets des del naixement fins a les nou setmanes d'edat, examinant la incidència de la malaltia, l'estat serològic dels animals i utilitzant la seqüenciació per determinar la transmissió i evolució del virus. Quan la granja estava a punt d'aconseguir l'estabilització, va tenir lloc un esdeveniment crític: una única falla en la vacunació de record de les truges relacionada a temperatures elevades a l'estiu va desencadenar un ressorgiment de la infecció. Aquesta omissió va resultar en un augment de gairebé el 100% de la incidència a les sis setmanes d'edat, una disminució de la immunitat materna i un augment de la diversitat genètica del virus. Remarcablement, abans d'aquest problema de vacunació, mentre la transmissió estava relativament controlada, la diversitat genètica del virus tenia una tendència decreixent. A més, l'estudi revela que tant la selecció com la recombinació van contribuir a la diversitat viral observada en aquesta granja. Els resultats subratllen la importància de l'estricta adherència a la vacunació en el control de la incidència i la diversitat genètica del PRRSV. En resum, els resultats d'aquesta tesi contribueixen a l'avanç de la nostra comprensió dels mecanismes subjacents a la persistència del PRRSV i la seva evolució dins de les granges sota pressió de la vacunació.