Understanding predictions of drug profiles using explainable machine learning models

The analysis of absorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME) molecular properties is of relevance to drug design, as they directly influence the drug’s effectiveness at its target location. This study concerns their prediction, using explainable Machine Learning (ML) models. The aim of...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores: König, Caroline|||0000-0002-7543-8686, Vellido Alcacena, Alfredo|||0000-0002-9843-1911
Tipo de recurso: artículo
Fecha de publicación:2024
País:España
Institución:Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)
Repositorio:UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
Idioma:inglés
OAI Identifier:oai:upcommons.upc.edu:2117/414759
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/2117/414759
https://dx.doi.org/10.1186/s13040-024-00378-w
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Molecular dynamics -- Computer simulation
Machine learning
ADME properties
Explainable machine learning
Molecular descriptors
Drug design
Dinàmica molecular -- Simulació per ordinador
Aprenentatge automàtic
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Intel·ligència artificial::Aprenentatge automàtic
Descripción
Sumario:The analysis of absorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME) molecular properties is of relevance to drug design, as they directly influence the drug’s effectiveness at its target location. This study concerns their prediction, using explainable Machine Learning (ML) models. The aim of the study is to find which molecular features are relevant to the prediction of the different ADME properties and measure their impact on the predictive model