Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors

L’objectiu d’aquesta tesi doctoral és explorar la utilització de proteïnes d’unió al ADN en la generació i amplificació de senyal en biosensors. L’alta especificitat i afinitat d’aquestes proteïnes per les seves respectives seqüencies específiques de ADN de doble cadena (ADNdc) ha sigut utilitzada p...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Aktas, Gülsen Betül
Tipo de recurso: tesis doctoral
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2017
País:España
Institución:CBUC, CESCA
Repositorio:TDR. Tesis Doctorales en Red
OAI Identifier:oai:www.tdx.cat:10803/458372
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10803/458372
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Biosensor
Proteïnes d’unió al ADN
Enginyeria de proteïnes
Proteínas de unión al ADN
Ingeniería de proteínas
DNA binding proteins
Protein Engineering
Ciències
543
577
6
66
id ES_3aa3433cb89846e4c8cd63c97de3989b
oai_identifier_str oai:www.tdx.cat:10803/458372
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors
title Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors
spellingShingle Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors
Aktas, Gülsen Betül
Biosensor
Proteïnes d’unió al ADN
Enginyeria de proteïnes
Proteínas de unión al ADN
Ingeniería de proteínas
DNA binding proteins
Protein Engineering
Ciències
543
577
6
66
title_short Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors
title_full Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors
title_fullStr Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors
title_full_unstemmed Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors
title_sort Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensors
dc.creator.none.fl_str_mv Aktas, Gülsen Betül
author Aktas, Gülsen Betül
author_facet Aktas, Gülsen Betül
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Masip Vernis, Lluis
Universitat Rovira i Virgili. Departament d'Enginyeria Química
dc.subject.none.fl_str_mv Biosensor
Proteïnes d’unió al ADN
Enginyeria de proteïnes
Proteínas de unión al ADN
Ingeniería de proteínas
DNA binding proteins
Protein Engineering
Ciències
543
577
6
66
topic Biosensor
Proteïnes d’unió al ADN
Enginyeria de proteïnes
Proteínas de unión al ADN
Ingeniería de proteínas
DNA binding proteins
Protein Engineering
Ciències
543
577
6
66
description L’objectiu d’aquesta tesi doctoral és explorar la utilització de proteïnes d’unió al ADN en la generació i amplificació de senyal en biosensors. L’alta especificitat i afinitat d’aquestes proteïnes per les seves respectives seqüencies específiques de ADN de doble cadena (ADNdc) ha sigut utilitzada per desenvolupar un sistema d’immobilització que permet la co-immobilització de forma controlada de múltiples proteïnes. El sistema proposat està basat en la utilització d’aquestes proteïnes d’unió al ADN com a etiquetes de fusió de les proteïnes a immobilitzar i amb l’ús conjunt d’una molècula de ADNdc que fa la funció de plantilla per a la co-immobilització degut al posicionament de les seqüències de ADN que reconeixen específicament aquestes proteïnes d’unió al ADN. Aquest treball descriu la preparació i caracterització de dos conjugats universals d’enzim-proteïna d’unió al ADN i demostra el seu ús en la generació i amplificació de senyal en biosensors per a la detecció d’àcids nucleics i proteïnes. A més, també es mostra la idoneïtat d’aquestes proteïnes d’unió al ADN per immobilitzar directament molècules de ADN.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017
2017
2019
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10803/458372
url http://hdl.handle.net/10803/458372
dc.language.none.fl_str_mv Inglés
language_invalid_str_mv Inglés
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 183 p.
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universitat Rovira i Virgili
publisher.none.fl_str_mv Universitat Rovira i Virgili
dc.source.none.fl_str_mv TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
reponame:TDR. Tesis Doctorales en Red
instname:CBUC, CESCA
instname_str CBUC, CESCA
reponame_str TDR. Tesis Doctorales en Red
collection TDR. Tesis Doctorales en Red
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869406249037070336
spelling Application of dna binding protein tags as means for defined co-immobilization in biosensorsAktas, Gülsen BetülBiosensorProteïnes d’unió al ADNEnginyeria de proteïnesProteínas de unión al ADNIngeniería de proteínasDNA binding proteinsProtein EngineeringCiències543577666L’objectiu d’aquesta tesi doctoral és explorar la utilització de proteïnes d’unió al ADN en la generació i amplificació de senyal en biosensors. L’alta especificitat i afinitat d’aquestes proteïnes per les seves respectives seqüencies específiques de ADN de doble cadena (ADNdc) ha sigut utilitzada per desenvolupar un sistema d’immobilització que permet la co-immobilització de forma controlada de múltiples proteïnes. El sistema proposat està basat en la utilització d’aquestes proteïnes d’unió al ADN com a etiquetes de fusió de les proteïnes a immobilitzar i amb l’ús conjunt d’una molècula de ADNdc que fa la funció de plantilla per a la co-immobilització degut al posicionament de les seqüències de ADN que reconeixen específicament aquestes proteïnes d’unió al ADN. Aquest treball descriu la preparació i caracterització de dos conjugats universals d’enzim-proteïna d’unió al ADN i demostra el seu ús en la generació i amplificació de senyal en biosensors per a la detecció d’àcids nucleics i proteïnes. A més, també es mostra la idoneïtat d’aquestes proteïnes d’unió al ADN per immobilitzar directament molècules de ADN.El objetivo de esta tesis doctoral es explorar la utilización de proteínas de unión al ADN en la generación y amplificación de señal en bionsensores. La alta especificidad y afinidad de estas proteínas por sus respectivas secuencias específicas de ADN de doble cadena (ADNdc) ha sido utilizada par a desarrollar un sistema de inmovilización que permite la co-inmovilización de forma controlada de múltiples proteínas. El sistema propuesto está basado en la utilización de estas proteínas de unión al ADN como etiquetas de fusión de las proteínas a inmovilizar y con el uso conjunto de una molécula de ADNdc que hace la función de plantilla para la co-inmovilización debido al posicionamiento de las secuencias de ADN que reconocen específicamente estas proteínas de unión al ADN. Este trabajo describe la preparación y caracterización de dos conjugados universales de enzima-proteína de unión al ADN y demuestra su uso en la generación y amplificación de señal en biosensores para la detección de ácidos nucleicos y proteínas. Además, también se muestra la idoneidad de estas proteínas de unión al ADN para inmovilizar directamente moléculas de ADN.The objective of this doctoral thesis is to explore the use of DNA binding proteins in biosensors for signal generation and amplification. The specificity and high affinity that these proteins exhibit for their respective double stranded DNA (dsDNA) sequence was thus exploited in order to develop a protein immobilization technique that allows the controlled co-immobilization of several proteins. The proposed system is based on the utilization of these DNA binding proteins as fusion tags for the target proteins to be immobilized and the use of dsDNA as the template to direct the protein co-immobilization by specific positioning of the target DNA sequences recognized by the DNA binding proteins. The preparation and characterization of two novel universal enzyme-DNA binding protein conjugates is described and their use for signal generation and amplification in biosensors for the detection of nucleic acid and protein targets is demonstrated. In addition, the suitability of these DNA binding proteins to directly immobilize DNA molecules is also shown.Universitat Rovira i VirgiliMasip Vernis, LluisUniversitat Rovira i Virgili. Departament d'Enginyeria Química201720192017info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion183 p.application/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/458372TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)reponame:TDR. Tesis Doctorales en Redinstname:CBUC, CESCAInglésADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.info:eu-repo/semantics/openAccessoai:www.tdx.cat:10803/4583722026-06-14T12:46:07Z
score 15.301603