Untangling chromatin: investigating the role of transcription, supercoiling and topoisomerases in genome organization
La organización del genoma en células mamíferas sigue siendo en gran parte desconocida. Un nivel fundamental de organización se considera el bucle de cromatina, que consiste en una región de ADN atrapada en el interior de un complejo cohesina en forma de anillo, a menudo flanqueado por dos proteínas...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2024 |
| País: | España |
| Institución: | CBUC, CESCA |
| Repositorio: | TDR. Tesis Doctorales en Red |
| OAI Identifier: | oai:www.tdx.cat:10803/690851 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/690851 |
| Access Level: | acceso embargado |
| Palabra clave: | Genome organization Chromatin Transcription Supercoiling Topoisomerases Compaction Organización del genoma Cromatina Transcripción Superenrollamiento Compactación 575 |
| Sumario: | La organización del genoma en células mamíferas sigue siendo en gran parte desconocida. Un nivel fundamental de organización se considera el bucle de cromatina, que consiste en una región de ADN atrapada en el interior de un complejo cohesina en forma de anillo, a menudo flanqueado por dos proteínas aislantes CTCFs. Aún se está investigando cómo se forman, mantienen y regulan estos bucles. Investigamos si la ARN polimerasa II es una fuerza impulsora para la translocación de cohesina en la cromatina. Mostramos que el superenrollamiento generado por la transcripción contribuye a la formación de bucles de cromatina y mejora la movilidad de la cohesina. Además, desarrollamos nuevos métodos sólidos para cuantificar cambios morfológicos en la cromatina dentro de las células utilizando microscopía confocal y de superresolución. Finalmente, investigamos en células individuales vivas el comportamiento de las enzimas que controlan la topología y el superenrollamiento del ADN: las topoisomerasas. En resumen, en este trabajo de tesis, estudié la relación entre la organización genómica, la transcripción y el superenrollamiento, y desarrollé enfoques novedosos para el análisis de la cromatina en células humanas. |
|---|