Bacterial gene diversity related to tryptophan metabolism and indole-3-acetic acid (IAA) production in the rhizosphere

Desde hace años, las rizobacterias han suscitado interés por su capacidad de promover el crecimiento vegetal. Una de las hormonas que estas bacterias producen y que tiene uno de los principales papeles en esta promoción es el ácido indoleacético. En este trabajo, se recoge toda la evidencia registra...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Suárez Pérez, Pablo
Tipo de recurso: tesis de maestría
Fecha de publicación:2020
País:España
Institución:Universitat Oberta de Catalunya (UOC)
Repositorio:O2, repositorio institucional de la UOC
OAI Identifier:oai:openaccess.uoc.edu:10609/108066
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10609/108066
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:IAA
rhizosphere
phylogenetics
tryptophan
rizosfera
filogenètica
triptòfan
filogenética
triptófano
Bioinformatics -- TFM
Bioinformàtica -- TFM
Bioinformática -- TFM
Descripción
Sumario:Desde hace años, las rizobacterias han suscitado interés por su capacidad de promover el crecimiento vegetal. Una de las hormonas que estas bacterias producen y que tiene uno de los principales papeles en esta promoción es el ácido indoleacético. En este trabajo, se recoge toda la evidencia registrada hasta el momento de las rutas de biosíntesis de esta hormona en rizobacterias, así como de su precursor, el aminoácido triptófano. Para cada una de las rutas y especies identificadas, se obtuvieron los genes y proteínas que intervienen en los diferentes puntos de cada ruta. A fin de analizar su diversidad, se realizó un estudio filogenético de cada una de las enzimas bajo estudio, se documentó su perfil proteico y se analizó la co-ocurrencia de rutas. Para estudiar su origen y evolución, se realizó a su vez una comparación con un marcador filogenético conocido (gyrB). Los resultados muestran una clara co-ocurrencia de enzimas y rutas, que en algunos casos puede ser explicada por la presencia de operones, así como ciertas divergencias en algunos casos en las comparaciones con los marcadores.