Identification of markers from whole-genome sequencing associated with pork quality and lipid metabolism
En aquesta tesi hem investigat l'adequació de les dades de WGS per identificar variants genètiques o indicadors biològics associats amb els trets productius, i ampliar el nostre coneixement sobre el determinisme genètic dels trets de qualitat de la carn.Els resultats mostren que una major densi...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2025 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat de Lleida (UdL) |
| Repositorio: | Repositori Obert UdL |
| OAI Identifier: | oai:repositori.udl.cat:10459.1/467522 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10803/693687 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Seqüenciació Marcadors genètics Lípids Secuenciación Marcadores genéticos Lípidos Sequencing Molecular markers Lipids Producció Animal 575 |
| Sumario: | En aquesta tesi hem investigat l'adequació de les dades de WGS per identificar variants genètiques o indicadors biològics associats amb els trets productius, i ampliar el nostre coneixement sobre el determinisme genètic dels trets de qualitat de la carn.Els resultats mostren que una major densitat de variants en les dades de WGS permet detectar nous QTL en comparació amb els xips de SNPs. Hem identificat múltiples variants genètiques amb potencial per a programes de selecció assistida per marcadors en desequilibri de lligament per a la deposició de greix i el contingut d'àcids grassos en el porc. També, les dades de WGS han permès dur a terme fine-mapping dels efectes de múltiples QTL dins de regions específiques, tant en gens candidats funcionals com en gens prioritzats segons altres criteris. Finalment, hem observat que el nombre de còpies d'ADN mitocondrial, un fenotip cel·lular que es pot estimar a partir de les dades de WGS, es correlaciona amb l'eficiència alimentària, la magresa i el pH final. Aquesta troballa obre una via interessant per comprendre la interacció entre el metabolisme cel·lular i els trets productius. |
|---|