Investigation on sRNA Biogenesis and Mechanism in Duckweeds: Loss of TAS1/TAS2 Transitivity

[ES] El silenciamiento genético exógeno es crucial para las plantas como un mecanismo de defensa contra virus y patógenos no deseados (ya sea en forma de material genético invasivo, T-DNA o transposones), principalmente mediante el uso de sRNAs. La transitividad amplifica la respuesta de silenciamie...

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Bibliographic Details
Author: Leon Contreras, Hania Paola
Format: master thesis
Publication Date:2025
Country:España
Institution:Universitat Politècnica de València (UPV)
Repository:RiuNet. Repositorio Institucional de la Universitat Politécnica de Valéncia
Language:English
OAI Identifier:oai:riunet.upv.es:10251/228713
Online Access:https://riunet.upv.es/handle/10251/228713
Access Level:Open access
Keyword:Transitividad
Defensa antiviral de las plantas (PTGS)
Duckweed
AGO1
Transitivity
Antiviral plant defense
Post-transcriptional gene silencing (PTGS)
Máster Universitario Erasmus Mundus en Mejora Genética Vegetal / Erasmus Mundus Master in Plant Breeding - emPLANT +-Màster Universitari Erasmus Mundus en Millora Genètica Vegetal / Erasmus Mundus Màster in Plant Breeding - emPLANT +
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spelling Investigation on sRNA Biogenesis and Mechanism in Duckweeds: Loss of TAS1/TAS2 TransitivityInvestigación sobre la biogénesis y el mecanismo del sRNA en la lenteja de agua: pérdida de la transitividad TAS1/TAS2Investigació sobre la biogènesi i el mecanisme del sRNA en la llentilla d&aposaigua: pèrdua de la transitivitat TAS1/TAS2Leon Contreras, Hania PaolaTransitividadDefensa antiviral de las plantas (PTGS)DuckweedAGO1TransitivityAntiviral plant defensePost-transcriptional gene silencing (PTGS)Máster Universitario Erasmus Mundus en Mejora Genética Vegetal / Erasmus Mundus Master in Plant Breeding - emPLANT +-Màster Universitari Erasmus Mundus en Millora Genètica Vegetal / Erasmus Mundus Màster in Plant Breeding - emPLANT +[ES] El silenciamiento genético exógeno es crucial para las plantas como un mecanismo de defensa contra virus y patógenos no deseados (ya sea en forma de material genético invasivo, T-DNA o transposones), principalmente mediante el uso de sRNAs. La transitividad amplifica la respuesta de silenciamiento al producir phasiRNAs secundarios que silencian la totalidad de la transcripción ajena. Sin embargo, aún teniendo todos los elementos necesarios para ello, esta respuesta no se encuentra en duckweed. El objetivo de esta investigación es entender el mecanismo detrás de la falta de transitividad en duckweed. La principal teoría es que AGO-1 se comporta diferente en duckweed a comparación de otras plantas, por lo que al insertar AGO-1 de tres diferentes especies de duckweed (L. minor, W. brasiliensis & S. polyrhiza) en mutantes de A. thaliana podremos descifrar si AGO-1 es la clave detrás del dilema de transitividad en duckweed.[EN] Exogenous gene silencing is crucial to plants as a defense mechanism against virus and unwanted pathogens (be it in the form of genetic material, transposons or T-DNA) mainly by using sRNAs. Transitivity amplifies the response of silencing by producing secondary phasiRNAs to target the totality of the foreign transcripts. However, even with all elements necessary for it, this response is not found in duckweeds. In this research the aim is to understand the mechanism behind the lack of transitivity in duckweed. Our main theory lies on AGO-1 behaving different in duckweed, thus by inserting AGO-1 from three different duckweed species in A. thaliana mutants, we will unravel if AGO-1 is the key behind the transitivity dilemma in duckweed. Universitat Politècnica de ValènciaVilanova Navarro, SantiagoDepartamento de BiotecnologíaInstituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad ValencianaEscuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio NaturalRepositorio Institucional de la Universitat Politècnica de València Riunet20252025-10-1420252025-09-25master thesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://riunet.upv.es/handle/10251/228713reponame:RiuNet. Repositorio Institucional de la Universitat Politécnica de Valénciainstname:Universitat Politècnica de València (UPV)Inglésengopen accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Reserva de todos los derechoshttp://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/info:eu-repo/semantics/openAccessoai:riunet.upv.es:10251/2287132026-06-13T07:49:27Z
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description [ES] El silenciamiento genético exógeno es crucial para las plantas como un mecanismo de defensa contra virus y patógenos no deseados (ya sea en forma de material genético invasivo, T-DNA o transposones), principalmente mediante el uso de sRNAs. La transitividad amplifica la respuesta de silenciamiento al producir phasiRNAs secundarios que silencian la totalidad de la transcripción ajena. Sin embargo, aún teniendo todos los elementos necesarios para ello, esta respuesta no se encuentra en duckweed. El objetivo de esta investigación es entender el mecanismo detrás de la falta de transitividad en duckweed. La principal teoría es que AGO-1 se comporta diferente en duckweed a comparación de otras plantas, por lo que al insertar AGO-1 de tres diferentes especies de duckweed (L. minor, W. brasiliensis & S. polyrhiza) en mutantes de A. thaliana podremos descifrar si AGO-1 es la clave detrás del dilema de transitividad en duckweed.
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