On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks

We prove that Nakhleh’s metric for reduced phylogenetic networks is also a metric on the classes of tree-child phylogenetic networks, semibinary tree-sibling time consistent phylogenetic networks, and multilabeled phylogenetic trees. We also prove that it separates distinguishable phylogenetic netwo...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores: Cardona, Gabriel, Llabrés, Mercè, Rosselló, Francesc, Valiente Feruglio, Gabriel Alejandro|||0000-0001-9194-2703
Tipo de recurso: artículo
Fecha de publicación:2009
País:España
Institución:Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)
Repositorio:UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
Idioma:inglés
OAI Identifier:oai:upcommons.upc.edu:2117/7141
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/2117/7141
https://dx.doi.org/10.1109/TCBB.2009.33.
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Biology
Genetics
Bioinformatics
Biologia
Bioinformàtica
Biologia computacional
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
id ES_07e76a1abd6a94d528bc56bc1f23d05e
oai_identifier_str oai:upcommons.upc.edu:2117/7141
network_acronym_str ES
network_name_str España
repository_id_str
spelling On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networksCardona, GabrielLlabrés, MercèRosselló, FrancescValiente Feruglio, Gabriel Alejandro|||0000-0001-9194-2703BiologyGeneticsBioinformaticsBiologiaBioinformàticaBiologia computacionalÀrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::BioinformàticaWe prove that Nakhleh’s metric for reduced phylogenetic networks is also a metric on the classes of tree-child phylogenetic networks, semibinary tree-sibling time consistent phylogenetic networks, and multilabeled phylogenetic trees. We also prove that it separates distinguishable phylogenetic networks. In this way, it becomes the strongest dissimilarity measure for phylogenetic networks available so far. Furthermore, we propose a generalization of that metric that separates arbitrary phylogenetic networks.Peer Reviewed20092009-11-0120102010-05-10journal articlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501VoRhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/2117/7141https://dx.doi.org/10.1109/TCBB.2009.33.reponame:UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPCinstname:Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)Inglésengopen accesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessoai:upcommons.upc.edu:2117/71412026-05-27T15:37:01Z
dc.title.none.fl_str_mv On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks
title On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks
spellingShingle On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks
Cardona, Gabriel
Biology
Genetics
Bioinformatics
Biologia
Bioinformàtica
Biologia computacional
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
title_short On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks
title_full On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks
title_fullStr On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks
title_full_unstemmed On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks
title_sort On Nakhleh's metric for reduced phylogenetic networks
dc.creator.none.fl_str_mv Cardona, Gabriel
Llabrés, Mercè
Rosselló, Francesc
Valiente Feruglio, Gabriel Alejandro|||0000-0001-9194-2703
author Cardona, Gabriel
author_facet Cardona, Gabriel
Llabrés, Mercè
Rosselló, Francesc
Valiente Feruglio, Gabriel Alejandro|||0000-0001-9194-2703
author_role author
author2 Llabrés, Mercè
Rosselló, Francesc
Valiente Feruglio, Gabriel Alejandro|||0000-0001-9194-2703
author2_role author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Biology
Genetics
Bioinformatics
Biologia
Bioinformàtica
Biologia computacional
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
topic Biology
Genetics
Bioinformatics
Biologia
Bioinformàtica
Biologia computacional
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
description We prove that Nakhleh’s metric for reduced phylogenetic networks is also a metric on the classes of tree-child phylogenetic networks, semibinary tree-sibling time consistent phylogenetic networks, and multilabeled phylogenetic trees. We also prove that it separates distinguishable phylogenetic networks. In this way, it becomes the strongest dissimilarity measure for phylogenetic networks available so far. Furthermore, we propose a generalization of that metric that separates arbitrary phylogenetic networks.
publishDate 2009
dc.date.none.fl_str_mv 2009
2009-11-01
2010
2010-05-10
dc.type.none.fl_str_mv journal article
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
VoR
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.openaire.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/2117/7141
https://dx.doi.org/10.1109/TCBB.2009.33.
url https://hdl.handle.net/2117/7141
https://dx.doi.org/10.1109/TCBB.2009.33.
dc.language.none.fl_str_mv Inglés
eng
language_invalid_str_mv Inglés
language eng
dc.rights.none.fl_str_mv open access
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.openaire.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv open access
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
instname:Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)
instname_str Universitat Politècnica de Catalunya (UPC)
reponame_str UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
collection UPCommons. Portal del coneixement obert de la UPC
repository.name.fl_str_mv
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1869403011173842944
score 15,300719

Similares en LA Referencia