Dinámica y Evolución de Variantes Genéticas en S. Cerevisiae: Diversificación Experimental en una Comunidad Bacteriana

La evolución experimental es una herramienta que permite poner a prueba hipótesis y teorías evolutivas, así como también evaluar la adaptación a diversos factores selectivos tanto abióticos como bióticos. En el caso de los factores bióticos, el uso de poblaciones de microorganismos nos permite estud...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Paleo-López, Rocío Macarena
Tipo de recurso: tesis de maestría
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2018
País:Chile
OAI Identifier:oai:repositorio.anid.cl:10533/219623
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/10533/219623
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Ciencias Naturales
Otras Ciencias Naturales
Descripción
Sumario:La evolución experimental es una herramienta que permite poner a prueba hipótesis y teorías evolutivas, así como también evaluar la adaptación a diversos factores selectivos tanto abióticos como bióticos. En el caso de los factores bióticos, el uso de poblaciones de microorganismos nos permite estudiar el efecto de la competencia sobre la evolución del genoma de una determinada especie. En esta tesis se contrastaron variantes (SNPs) encontradas en un 3% del genoma de S. cerevisiae bajo condiciones de interacción bacteriana (factor selectivo) y en condiciones sin interacción bacteriana, en una diversificación experimental durante ~600 generaciones. Particularmente planteamos que la evolución en presencia de bacterias tiene un efecto sobre las poblaciones de levaduras, el cual es observable a nivel genómico. Se propone que este efecto es debido a que los cambios en el medio ambiente resultan en selección natural detectable por variantes alélicas específicas asociadas a la adaptación a estas condiciones. Para esto, realizamos una diversificación experimental de linajes con una población ancestral de S. cerevisiae (cepa Y55) en condiciones co-evolutivas con diferentes bacterias (factor selectivo) y se comparó con una diversificación experimental sin bacterias. Posteriormente analizamos mediante RAD-sequencing la diversidad genética adyacente a ~2200 sitios de restricción repartidos a lo largo del genoma (aprox 3% del genoma) en poblaciones terminales y ancestrales de ambas diversificaciones experimentales. Reportamos que existió una diferencia significativa en la diversidad genética entre tratamientos, también se obtuvo que la dinámica de las variantes encontradas se mantuvo en el tiempo para la mayoría de los SNPs encontrados en ambos tratamientos, así como también la diversidad genética. Por ende, estos resultados nos indican que la selección podría estar modelando la dinámica de las variantes en las poblaciones, manteniendo su frecuencia en el tiempo, así como también la diversidad genética durante un proceso de diversificación experimental en condiciones comunitarias.