Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático
Neste estudo foi implementado um pipeline bioinformático para processar e analisar dados de RNA-Seq total e fita-específico gerados em nosso laboratório a partir de amostras pareadas de tumor e tecido adjacente não tumoral de 14 pacientes com o objetivo de catalogar com alta-resolução a composição e...
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2019 |
| País: | Brasil |
| Institución: | Universidade de São Paulo (USP) |
| Repositorio: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| Idioma: | portugués |
| OAI Identifier: | oai:teses.usp.br:tde-26042019-164116 |
| Acceso en línea: | http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-26042019-164116/ |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Câncer pancreático Pancreatic cancer RNA-Seq Transcriptomic Transcritômica |
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Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreáticoIdentification and functional annotation of novel transcripts with altered expression in pancreatic cancerCâncer pancreáticoPancreatic cancerRNA-SeqRNA-SeqTranscriptomicTranscritômicaNeste estudo foi implementado um pipeline bioinformático para processar e analisar dados de RNA-Seq total e fita-específico gerados em nosso laboratório a partir de amostras pareadas de tumor e tecido adjacente não tumoral de 14 pacientes com o objetivo de catalogar com alta-resolução a composição e alterações no transcritoma no PDAC incluindo genes codificadores e não codificadores de proteína.In the present work, we applied a bioinformatic pipeline to process and analyse data from total RNA-seq strand-oriented generated in our laboratory from matched samples of tumor and non-tumor adjacent pancreatic tissue from 14 patients with the goal of generate a high resolution catalog of the composition and the alterations in the transcriptome of PDAC, including protein coding and non coding genes.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPReis, Eduardo Moraes RegoSetubal, João Carlos2019-02-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-26042019-164116/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccessporSosa, Omar Julio2019-06-07T17:58:13Zoai:teses.usp.br:tde-26042019-164116Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212019-06-07T17:58:13Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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Neste estudo foi implementado um pipeline bioinformático para processar e analisar dados de RNA-Seq total e fita-específico gerados em nosso laboratório a partir de amostras pareadas de tumor e tecido adjacente não tumoral de 14 pacientes com o objetivo de catalogar com alta-resolução a composição e alterações no transcritoma no PDAC incluindo genes codificadores e não codificadores de proteína. |
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