| Sumario: | El café (Coffea arabica) por ser un cultivo de agroexportación del Perú, es considerado de suma importancia su calidad en producción de grano; sin embargo, en la actualidad se desconoce las especies de Meloidogyne que se encuentran causando daños a la raíz de este cultivo. El objetivo del presente estudio fue caracterizar los principales géneros de nematodos presentes en el cultivo de café en la región Puno, identificar las principales especies de Meloidogyne, presentes este cultivo y verificar la fluctuación poblacional en plantaciones de café. La metodología del presente trabajo de investigación fue descriptiva y análisis de laboratorio de las diferentes muestras que fueron procesadas en el laboratorio de electroforesis de la Universidad Nacional del Altiplano. Para la caracterización isoenzimatica se extrajeron 20 hembras de raíces infestadas de café, por cada muestra, también se analizaron individuos morfológicamente. Los géneros de nematodos fitoparásitos identificados fueron Meloidogyne, Helicotylenchus, Pratylenchus, Xiphinema, Mesocriconema, Dorylaimus, Tylenchus, Hemicycliophora, Mononchus y nematodos de vida libre. Isoenzimaticamente en la identificación de Meloidogyne se encontraron las especies de M. exigua (Est. E1 y E2). Se verifico que las especies de M. exigua (Est. E1 y E2) son altamente patogénicas en cultivo de café y las densidades poblacionales del género Meloidogyne fue del 95 % de la población en el cultivo de Café (Coffea arábica).
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