Una nueva variante del papilomavirus humano tipo 16, circulante en San Luis Potosi
"Identificar y determinar la frecuencia de subtipos y variantes del papilomavirus humano tipo 16 (HPV16) circulantes en mujeres con infecciones del cérvix en los estados de San Luis Potosí y Guanajuato. MÉTODOS. Empleamos DNA de 50 muestras de exudados cervicales previamente tipificadas en nues...
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| Formato: | tesis de maestría |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2005 |
| País: | México |
| Recursos: | Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica |
| Repositorio: | Repositorio Institucional del IPICYT |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:ipicyt.repositorioinstitucional.mx:1010/756 |
| Acesso em linha: | http://ipicyt.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1010/374 http://ipicyt.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1010/756 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palavra-chave: | info:eu-repo/classification/AUTOR/Virus del Papiloma Humano info:eu-repo/classification/Autor/Cáncer info:eu-repo/classification/cti/2 info:eu-repo/classification/cti/24 info:eu-repo/classification/cti/2415 |
| Resumo: | "Identificar y determinar la frecuencia de subtipos y variantes del papilomavirus humano tipo 16 (HPV16) circulantes en mujeres con infecciones del cérvix en los estados de San Luis Potosí y Guanajuato. MÉTODOS. Empleamos DNA de 50 muestras de exudados cervicales previamente tipificadas en nuestro laboratorio como HPV16-positivas con infección única; 48 provenían de San Luis Potosí y dos de Guanajuato. Obtuvimos amplicones E6/E7 (626 pb) de las 50 muestras mediante PCR anidada con la pareja de oligonucleótidos E6F/PU-2R16 empleando como molde el producto LCR/E7 (650 pb) obtenido en la primera reacción de PCR. En las mezclas de PCR anidadas incluimos tres controles, dos positivos: plásmidos pHPV16 y pHPV18; y uno negativo: mezcla completa sin DNA. Los amplicones fueron secuenciados en el Laboratorio Nacional de Genómica del CINVESTAV-Irapuato. Comparamos las secuencias mediante alineamiento múltiple usando el programa ClustalW . Determinamos los subtipos y las variantes de HPV16 a partir de las secuencias completas del marco de lectura abierto (ORF) del gen E6 (Yamada et al. 1997). Predijimos las secuencias de aminoácidos de la proteína E6 con el programa Translate tool de la base de datos ExPASy. Construimos los dendrogramas de las secuencias de nucleótidos del gen E6 usando el método UPGMA con los programas Phylip y MEGA. RESULTADOS. La longitud promedio de bases secuenciadas, obtenidas de los 50 amplicones E6/E7 de 626 pb, fue 564 ± 63 pb (coeficiente de variación = 11.2%). Pudimos identificar los subtipos de HPV16 en el 98% (49/50) de las secuencias, y las variantes en el 94% (46/49) de las secuencias. Los dos subtipos identificados fueron el Europeo, E (n = 45, 92%) y el Asiático-Americano, AA (n = 4, 8%). Entre las variantes del subtipo E la más frecuente fue la de referencia (E-P) con 31 casos (62%), seguida por la E-350G con ocho casos (16%). Las variantes del subtipo E menos frecuentes fueron las E-C188G (dos casos, 4%) y E-A176G (un caso, 2%). Las variantes del subtipo AA fueron AA-a (dos casos, 4%) y AA-c (dos casos, 4%). Identificamos además 26 mutaciones puntuales adicionales a las de los subtipos y variantes conocidos entre 37 de las 46 secuencias: 16 sustituciones, seis inserciones y cuatro deleciones." |
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