Análisis filogenético-funcional de regiones de control replicativo y transcripcional en virus de DNA de cadena sencilla
"La mayoría de los virus con genomas circulares de DNA de cadena sencilla se replican por el mecanismo de círculo rodante. Esta característica hace que todos codifiquen una proteína iniciadora de la replicación que tiene actividad de endonucleasa, usualmente conocida como Rep. Las relaciones ev...
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2010 |
| País: | México |
| Institución: | Instituto Potosino de Investigación Científica y Tecnológica |
| Repositorio: | Repositorio Institucional del IPICYT |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:ipicyt.repositorioinstitucional.mx:1010/684 |
| Acceso en línea: | http://ipicyt.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1010/201 http://ipicyt.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1010/684 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | info:eu-repo/classification/Autor/β- glucuronidasa info:eu-repo/classification/Autor/Promotor info:eu-repo/classification/Autor/Protoplastos info:eu-repo/classification/Autor/Recombinación info:eu-repo/classification/Autor/Huella bio-geográfica info:eu-repo/classification/Autor/Curtovirus info:eu-repo/classification/Autor/Proteina Rep info:eu-repo/classification/Autor/Iterones info:eu-repo/classification/Autor/Nanovirus info:eu-repo/classification/Autor/Circovirus info:eu-repo/classification/Autor/Geminivirus info:eu-repo/classification/Autor/Circulo rodante info:eu-repo/classification/cti/2 info:eu-repo/classification/cti/24 info:eu-repo/classification/cti/2415 |
| Sumario: | "La mayoría de los virus con genomas circulares de DNA de cadena sencilla se replican por el mecanismo de círculo rodante. Esta característica hace que todos codifiquen una proteína iniciadora de la replicación que tiene actividad de endonucleasa, usualmente conocida como Rep. Las relaciones evolutivas entre los virus que codifican esas proteínas Rep no son claras. Se usó un análisis teórico con una aproximación heurística para analizar el origen de replicación y la respectiva proteína Rep de tres familias virales (Geminiviridae, Nanoviridae y Circoviridae), con el fin de detectar similitudes funcionales que indiquen relaciones evolutivas entre ellas; los resultados muestran que en todos los casos la proteína Rep tiene dos regiones con la misma configuración espacial que están involucradas en la unión específica a secuencias repetidas, llamadas iterones, presentes en el origen de replicación viral, y esto hace que las tres familias resulten más emparentadas de lo que antes se pensaba. Por otro lado se identificaron huellas biogeográficas en la proteína Rep de los virus del género Curtovirus (familia Geminiviridae) y señales de eventos de recombinación que indican que los miembros típicos de éste género probablemente se diversificaron en Norteamérica, tras adquirir un segmento genómico de un begomovirus (otro género de los geminivirus) que permaneció aislado por millones de años en Sudamérica. Adicionalmente, se estableció un sistema de preparación de protoplastos a partir de células vegetales cultivadas en suspensión, el cual se estandarizó midiendo la actividad β-glucuronidasa generada por promotores de begomovirus fusionados al gen uidA; dicho sistema sirve para hacer experimentos de relevancia en los campos de la virología y biología molecular de plantas, por ejemplo aquellos surgidos de los análisis teóricos." |
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