Microorganismos asociados a la rizosfera de jitomate en un agroecosistema del valle de Guasave, Sinaloa, México

La diversidad de los microorganismos asociados a la rizosfera de diferentes especies vegetales en los suelos, en México se ha estudiado poco y se ha abordado de manera convencional, con técnicas microbiológicas limitadas debido al elevado porcentaje de microorganismos no-cultivables (95-99%). En el...

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Detalles Bibliográficos
Autores: Jesús Damián Cordero-Ramírez, Raquel López-Rivera, Carlos Ligne Calderón-Vázquez, Alejandro Miguel Figueroa-López, Juan Carlos Martínez-Álvarez, Karla Yeriana Leyva-Madrigal, Rocío Guadalupe Cervantes-Gámez, Ignacio Eduardo Maldonado-Mendoza
Tipo de recurso: artículo
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2012
País:México
Institución:Instituto Politécnico Nacional
Repositorio:Redalyc-IPN
OAI Identifier:oai:redalyc.org:42525103014
Acceso en línea:https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=42525103014
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Biología
ITS
Rizosfera
ADN ribosomal
jitomate cultivado
Descripción
Sumario:La diversidad de los microorganismos asociados a la rizosfera de diferentes especies vegetales en los suelos, en México se ha estudiado poco y se ha abordado de manera convencional, con técnicas microbiológicas limitadas debido al elevado porcentaje de microorganismos no-cultivables (95-99%). En el presente trabajo se empleó el análisis por secuenciación del ADN ribosomal (ADNr) para evitar esa limitante y explorar mejor la diversidad de los microorganismos cultivables y no-cultivables asociados al jitomate (Solanum lycopersicum L.) en un agroecosistema en Sinaloa. Se empleó ADN genómico extraído del suelo rizosférico para amplificar una región hipervariable en el ADNr empleando oligonucleótidos universales para ADNr procariota y eucariota. El análisis de 194 y 384 secuencias de ADNr de origen procariota y eucariota, respectivamente, mostró que los phyla eucariotes más abundantes fueron Ascomycota (59%), Chlorophyta (21%) y Basidiomycota (12%), y los más abundantes de origen procariote fueron Firmicutes (45%), Proteobacteria (14.7%) y Gemmatimonadetes (13.1%). El presente trabajo representa a la fecha la caracterización más completa de la diversidad de microorganismos de la rizosfera del jitomate. Se discute el papel que especies identificadas en este trabajo, pertenecientes a géneros procariotas (Bacillus y Paenibacillus) y eucariotas (Alternaria), pudieran desempeñar en la rizosfera del jitomate y en el control biológico de fitopatogénos en esta especie.