Diversidad genética en sotol (dasylirion cedrosanum) a través de marcadores moleculares aflp y comparación entre plantas estaminadas y pistiladas

" El Sotol (Dasylirion spp.) es una planta nativa de las tierras semiáridas del Norte de México que se extiende al suroeste de Estados Unidos. La planta es perenne, policárpica y semicilíndrica grande, dioica, perennifolia, tallo corto con una inflorescencia o escapo de 1.5 a 5.5 metros de altu...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Morales Reyes, Yonis Alberto
Tipo de recurso: tesis de maestría
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2014
País:México
Institución:Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro
Repositorio:Repositorio Digital CID-UAAAN
OAI Identifier:oai:repositorio.uaaan.mx:123456789/7551
Acceso en línea:http://repositorio.uaaan.mx:8080/xmlui/handle/123456789/7551
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Dasylirion cedrosanum
Marcadores AFLP
Marcadores ISSR
CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA
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Ramírez Godina, Francisca
Rodríguez Herrera, Raúl
González Uribe, Dino Ulises
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description " El Sotol (Dasylirion spp.) es una planta nativa de las tierras semiáridas del Norte de México que se extiende al suroeste de Estados Unidos. La planta es perenne, policárpica y semicilíndrica grande, dioica, perennifolia, tallo corto con una inflorescencia o escapo de 1.5 a 5.5 metros de altura, tolerante a la sequía y temperaturas, pertenece a la familia de las Asparagaceae. Actualmente es la base de la industria especializada en producción de “sotol”. Este sector productivo carece de estudios de diversidad genética y capacidad reproductiva de las poblaciones que son parámetros útiles para definir aprovechamientos sustentables. El presente trabajo tuvo por objetivos estimar la diversidad genética a través de marcadores moleculares AFLP, implementar la técnica ISSR y validar vi marcadores y proporciones entre sexos. Para esto fueron evaluados grupos de 40 y 400 individuos respectivamente, todos provenientes de cinco poblaciones distribuidas entre Coahuila y Zacatecas, México. Se extrajo DNA para las técnicas AFLP e ISSR. Para los AFLPs se utilizaron los iniciadores M-CTG, E-AAC y E-AGG mientras que para ISSR los iniciadores fueron OH, W7, 3 y W902. Estos últimos fueron optimizados inicialmente en dos compuestos de DNA (10 hembras y 10 machos) y validados en 20 plantas. De los geles obtenidos se construyeron matrices binarias de presencia y ausencia de bandas para hacer el análisis de diversidad. Se aplicó la prueba exacta de Fisher para evaluar asociación significativa entre marcadores y el sexo, mientras que la prueba de chi cuadrada se utilizó para analizar las proporciones de sexos en la floración de 2010 a 2013. Para el análisis genético concluyente no se consideró el gel a 800 nm y fue eliminada la localidad de San Miguel, ambos por presentar problemas en la amplificación. El análisis reveló una diversidad genética de Nei entre 0.01476 y 0.10502 con carencia de estructura (Fst = 0.0071) como evidencia que las poblaciones forman una mega población con presencia de diversidad genética y ausencia de bandas asociadas al sexo. Se optimizaron cuatro iniciadores ISSR y se encontró que el ISSR-OH es el más apropiado para estimar diversidad genética. Se observó un desajuste global en la relación a la proporción 1:1 entre sexos con sesgo hacia las hembras en las poblaciones."
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El presente trabajo tuvo por objetivos estimar la diversidad genética a través de marcadores moleculares AFLP, implementar la técnica ISSR y validar vi marcadores y proporciones entre sexos. Para esto fueron evaluados grupos de 40 y 400 individuos respectivamente, todos provenientes de cinco poblaciones distribuidas entre Coahuila y Zacatecas, México. Se extrajo DNA para las técnicas AFLP e ISSR. Para los AFLPs se utilizaron los iniciadores M-CTG, E-AAC y E-AGG mientras que para ISSR los iniciadores fueron OH, W7, 3 y W902. Estos últimos fueron optimizados inicialmente en dos compuestos de DNA (10 hembras y 10 machos) y validados en 20 plantas. De los geles obtenidos se construyeron matrices binarias de presencia y ausencia de bandas para hacer el análisis de diversidad. Se aplicó la prueba exacta de Fisher para evaluar asociación significativa entre marcadores y el sexo, mientras que la prueba de chi cuadrada se utilizó para analizar las proporciones de sexos en la floración de 2010 a 2013. Para el análisis genético concluyente no se consideró el gel a 800 nm y fue eliminada la localidad de San Miguel, ambos por presentar problemas en la amplificación. El análisis reveló una diversidad genética de Nei entre 0.01476 y 0.10502 con carencia de estructura (Fst = 0.0071) como evidencia que las poblaciones forman una mega población con presencia de diversidad genética y ausencia de bandas asociadas al sexo. Se optimizaron cuatro iniciadores ISSR y se encontró que el ISSR-OH es el más apropiado para estimar diversidad genética. Se observó un desajuste global en la relación a la proporción 1:1 entre sexos con sesgo hacia las hembras en las poblaciones.""The Sotol (Dasylirion spp.) is a plant native to the arid lands of Northern Mexico that extends to the southwestern United States of America. The plant is perennial, large semicylindrical polycarpic, dioecious and evergreen, with a short stem or inflorescence stick 1.5 to 5.5 meters tall, drought temperature and tolerant and it belongs to the Asparagaceae family. It is currently the basis of the production of a liquour called "sotol". This productive sector lacks genetic diversity and reproductive potential studies. Which are useful parameters to define sustainable harvesting. The objectives of this study were to estimate genetic diversity through AFLP molecular markers, implementation of the ISSR technique and validation of markers and sex ratios. Groups of 40 and 400 individuals were evaluated respectively, all from five populations distributed in Coahuila and Zacatecas, Mexico. DNA was isolated for the AFLP and ISSR techniques. For the AFLP technique, primers M-CTG, E-AAC and E-AGG were used whereas for ISSR the primers were OH, W7, 3 and W902. The latter were initially optimized in two compounds of DNA (10 females and 10 males) and validated in 20 plants. From the electrophoresis gels binary matrices of presence and absence of band were constructed for diversity analysis. The Fisher's exact test was applied to assess significant association between markers and sex data, whereas chi square tests were applied to test sex ratios from 2010 to 2013 flowering years. For conclusive genetic analysis the gel at 800 nm was not considered, whereas the San Miguel location was eliminated, both showing amplification problems. The analysis revealed a Nei genetic diversity between 0.01476 and 0.10502, with lack of structure (Fst = 0.0071) as evidence that the populations are part of a mega-population with presence of genetic diversity and absence of bands associated with gender. Four ISSR primers were optimized, with the ISSR-OH being the most appropriate for estimating genetic diversity. A global departure from the 1:1 sex ratio of 1:1 was observed, with a bias toward female plants."Reyes Valdés, Manuel HumbertoRamírez Godina, FranciscaRodríguez Herrera, RaúlGonzález Uribe, Dino Ulises2014-12Versión publicadainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisPDFhttp://repositorio.uaaan.mx:8080/xmlui/handle/123456789/7551reponame:Repositorio Digital CID-UAAANinstname:Universidad Autónoma Agraria Antonio Narroinstacron:UAAANEspañolAcceso AbiertoCC BY-NC-ND - Atribución-NoComercial-SinDerivadasinfo:eu-repo/semantics/openAccessoai:repositorio.uaaan.mx:123456789/75512025-11-26T19:52:53Z
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