Distribución y abundancia de microorganismos marinos en el Golfo de México, identificados mediante citometría de flujo
En las aguas del Golfo de México (GoM), además de los organismos conocidos, es esperable que exista una gran diversidad de microorganismos con potencial aplicación tecnológica. Sin embargo, un paso previo antes de la descripción de dichas aplicaciones y funciones bioquímicas, es necesario realizar e...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2019 |
| País: | México |
| Institución: | Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada |
| Repositorio: | Repositorio Institucional CICESE |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:cicese.repositorioinstitucional.mx:1007/3062 |
| Acceso en línea: | http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3062 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | info:eu-repo/classification/Autor/SYBR Green I, Beta-diversidad, gradientes de profundidad info:eu-repo/classification/Autor/Beta-diversity, depth gradients, DNA, microbial diversity info:eu-repo/classification/cti/2 info:eu-repo/classification/cti/24 info:eu-repo/classification/cti/2417 info:eu-repo/classification/cti/241705 |
| Sumario: | En las aguas del Golfo de México (GoM), además de los organismos conocidos, es esperable que exista una gran diversidad de microorganismos con potencial aplicación tecnológica. Sin embargo, un paso previo antes de la descripción de dichas aplicaciones y funciones bioquímicas, es necesario realizar estudios que describan la estructura de las comunidades microbianas, en un ambiente de enormes dimensiones como el GoM. En este trabajo, se realizó el análisis de la abundancia y distribución de la evidencia de la presencia de microorganismos marinos a través de diferentes zonas y profundidades del GoM mediante citometría de flujo, una técnica ampliamente utilizada en el estudio de ambientes marinos. Con el fin de alcanzar este objetivo, se analizaron 235 muestras de agua marina mediante citometría flujo obtenidas a partir de tres campañas oceanográficas llevadas a cabo en los años 2016, 2017 y 2018, donde se obtuvieron alícuotas de agua a distintas profundidades: superficie, máximo de fluorescencia, mínimo de oxígeno, mil metros y fondo, en 47 estaciones del GoM. Para identificar moléculas orgánicas y microorganismos se utilizó un colorante afín a ácidos nucleicos (SYBR Green I) y se catalogaron los eventos positivos al colorante de acuerdo con el tamaño relativo de cada partícula. A partir de la información del citómetro, se construyeron mapas de distribución y abundancia, por gradiente y se realizó un análisis de diversidad beta, mediante el índice de Bray-Curtis, para identificar similitudes entre las poblaciones de eventos positivos al colorante y posibles patrones asociados a la ubicación geográfica del muestreo. Lo anterior, permitió identificar dos zonas, una al norte y otra al sur del Golfo de México, Cinturón Plegado de Perdido del Golfo y la Bahía de Campeche, respectivamente, que se caracterizan cada una por compartir al menos el 50% de similitud entre las poblaciones de partículas positivas a ADN. Además, la presencia de estas partículas, inferimos, se debe a la existencia de microorganismos que se distribuyen por distintos cambios en las corrientes marinas. Con este trabajo se genera un primer paso para estudios sobre la diversidad filogenética y funcional del GoM. |
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