Perfil transcriptómico de células epiteliales primarias de próstata humana inducidas a senescencia por estrés (SIPS)

La célula senescente se caracteriza por encontrarse detenida en las fases iniciales del ciclo celular, presentar resistencia ante la apoptosis y por diversas alteraciones en la expresión génica. Poco se conoce acerca de las aberraciones transcriptómicas ocasionadas por la senescencia en células epit...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: KEVIN SAMAEL OLASCOAGA DEL ANGEL
Tipo de recurso: tesis de maestría
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2019
País:México
Institución:Universidad Autónoma Metropolitana
Repositorio:Repositorio Institucional de la UAM Iztapalapa
Idioma:español
OAI Identifier:oai:bindani.izt.uam.mx:12579s30p
Acceso en línea:https://doi.org/10.24275/uami.12579s30p
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:info:eu-repo/classification/LEM/Prostate -- Cáncer
info:eu-repo/classification/LEM/Biología experimental
info:eu-repo/classification/LEM/Transcriptoma
info:eu-repo/classification/LEM/Biology, Experimental
info:eu-repo/classification/LEM/Próstata
info:eu-repo/classification/LEM/Acculturation
info:eu-repo/classification/LEM/Cells -- Aging
info:eu-repo/classification/LEM/Células
info:eu-repo/classification/cti/2
Descripción
Sumario:La célula senescente se caracteriza por encontrarse detenida en las fases iniciales del ciclo celular, presentar resistencia ante la apoptosis y por diversas alteraciones en la expresión génica. Poco se conoce acerca de las aberraciones transcriptómicas ocasionadas por la senescencia en células epiteliales de próstata, existe evidencia parcial de que estas perturbaciones podrían contribuir con la aparición y progresión de diversas enfermedades prostáticas. En este trabajo se analizó el transcriptoma de las células HPEC inducidas a senescencia por SIPS con el objetivo de determinar cuáles son las alteraciones en los patrones de expresión de diversos transcritos como mRNA, lncRNA, circRNA y miRNA. Una vez determinados los análisis de expresión diferencial génica se realizaron análisis de enriquecimiento de vías de señalización y términos ontológicos para conocer las funciones moleculares, biológicas y los componentes celulares que resultan afectados por las alteraciones en la expresión génica. Los resultados de esos enriquecimientos mostraron afectaciones en vías de señalización como como NRF2, TGF-β, VEGFA-VEGFR e IFNγ, ErbB, Hippo, MAPK, PI3K-Akt y Wnt. Asimismo, en las células HPEC inducidas SIPS se confirmó la presencia de 20 genes que ya han sido reportados en otros modelos como parte del núcleo de genes asociados a la senescencia. De ellos, 9 genes presentan la mayor cantidad de interacciones proteína – proteína y patrones de co-expresión. Además, se realizaron redes de interacción mRNA – miRNA y mRNA – mirRNA – CircRNA para tratar de encontrar los mecanismos de regulación que rigen la expresión de estos genes. Las alteraciones presentes en el transcriptoma de HPEC provocadas por la senescencia se asocian con procesos como carcinogénesis, metástasis, aparición y progresión de neoplasias, disminución de la respuesta inmunológica y aumento de resistencia a la apoptosis